مطالعه ژن هاي موثر بر توليد الياف پشم در گوسفند برپايه آناليز هستي شناسي

هدف: به دليل اهميت اقتصادي پشم گوسفند، تاكنون تحقيقات گسترده اي در زمينه ساختار و اساس ژنتيكي آن صورت گرفته است. شناسايي ژن‌ هاي مؤثر بر صفات اقتصادي از اهداف مهم اصلاح نژادي در پرورش گوسفند است. از پتانسيل ژنتيكي و عملكردي ژن ها مي توان در جهت دستيابي به محصولات توليدي با بهترين كيفيت و كميت استفاده نمود. براي تجزيه و تحليل داده‌هاي حجيم، روشهاي تعيين توالي مقرون به صرفه‌اي وجود دارد كه به درك مكانيسم‌ها و زمينه ژنتيكي صفات مختلف كمك كرده است. شناسايي ويژگي‌هاي متفاوت ژن‌هاي كانديد و انواع ژنوتيپ‌هاي مرتبط با صفات مهم فنوتيپي، در اصلاح نژاد حيوانات ضروري است. لذا، هدف از مطالعه حاضر شناسايي ژن هاي موثر بر توليد الياف پشم در گوسفند بر پايه آناليزهاي عملكردي آن ژنها مي باشد.مواد و روش‌ها: ابتدا داده‌هاي مورد استفاده براي اين تحقيق از پايگاه داده‌اي GEO با شماره دسترسي GSE85844 دانلود شدند. در پژوهش حاضر معيار انتخاب ژن‌ها تفاوت بيان در دامنه ( 0.3 0.3 LogFC) و آماره P value در سطح كمتر از 5 درصد بود. پس از شناسايي و مشخص شدن ژن‌ها با تفاوت معني‌دار براي آناليز هستي‌شناسي ژن‌ها از پايگاه داده DAVID استفاده شد. به منظور بررسي برهمكنش و ارتباط بين ژن‌هاي درگير در توليد الياف پشم از پايگاه اطلاعاتي STRING استفاده و آناليز شبكه توسط بسته نرم افزاري Cytoscape انجام شد. نتايج: تعداد 1008 ژن با بيان متفاوت و معني‌دار شناسايي شد (p 0.05). ژن‌ها با Log FC 0.3 بيان پاييني دارند و تعداد آن‌ها 431 عدد بود و ژن‌هاي با Log FC 0.3 بيان بالايي دارند و تعداد آن‌ها 577 عدد است. نتايج هستي‌شناسي براي ژن ‌هاي CHRD و PLOD1 BMP4 و ITGA5 نشان داد كه اين ژن‌ها در مسيرهاي مرتبط با مورفوژنز و ساخت تارهاي مو، بازسازي فوليكول‌هاي مو و توسعه و تراكم پوست مؤثر هستند.نتيجه گيري: انتخاب براي بهبود كيفي در پشم توليدي در گوسفندان با استفاده از اين يافته‌ ها، سبب تسريع پيشرفت ژنتيكي برنامه هاي اصلاح نژادي مرتبط خواهد گرديد.