انگشت‌نگاري ژنتيكي جدايه‌هاي باكتري اشريشيا‌كلي جمع‌آوري شده از حيوانات باغ ‌وحش كرمان با روش ERIC-PCR

انگشت‌نگاري ژنتيكي سويه‌هاي باكتري اشريشياكلي در يك زيستگاه مي‌تواند كمك شاياني به درك ما از تنوع ژنتيكي و چرخش آنها در ميزبان‌هاي مختلف كند. در اين مطالعه، تعداد 48 نمونه مدفوع از 24 نوع گونه حيوان سالم در باغ‌ وحش كرمان توسط سوآپ استريل جمع‌آوري شد. پس از جداسازي اشريشياكلي، سويه‌ها با روش ERIC-PCR، انگشت‌نگاري ژنتيكي شده و الگوي باندهاي به‌دست آمده از الكتروفورز با نرم‌افزار Gel Quest كاليبره و تجزيه و تحليل شد. در گام بعد شباهت انواع ERIC با ترسيم درخت فيلوژنتيك توسط نرم‌افزار Cluster Viz با استفاده از الگوريتم UPGMA نشان داده شد. در اين روش با قطع تشابه ≥90 درصد، 22 كلون مورد شناسايي قرار گرفت؛ الگوي ERIC جدايه‌هاي كبوتر با يك جدايه از طاووس، همچنين جدايه‌هاي شترمرغ با يك جدايه از طاووس، شباهت 100 درصدي داشت. جدايه‌هاي مرغ شاخدار، كاسكو و يك جدايه از شاه‌بوف با شباهت 100درصدي از نظر الگوي ERIC در كنار هم قرار گرفتند. همچنين جدايه‌هاي شتر و يك جدايه از شاه‌بوف شباهت 100 درصدي را در الگوي ERIC از خود نشان دادند. با توجه به اينكه چندين سويه جدا شده از ميزبان‌هاي مختلف با گونه‌هاي متفاوت داراي شباهت 100 درصد در الگوي ERIC بودند، مي‌توان نتيجه گرفت به علت نزديك بودن اين گونه‌‌هاي مختلف حيواني در يك زيستگاه مانند باغ ‌وحش، باعث شده است كه اين سويه‌ها در بين حيوانات مختلف در گردش باشد.