بررسي پروفايل بياني miRNAهاي اگزوزومي در سلول‌هاي سرطاني سرويكس (HeLa) در مقايسه با سلول‌هاي سالم و بررسي ژن‌هاي كليدي وابسته به آنها

مقدمه: سرطان سرويكس، چهارمين سرطان شايع در ميان زنان در سرتاسر جهان و يك بيماري هتروژن مي باشد. miRNAهاي اگزوزومي مي توانند به‌عنوان بيوماركرهاي تشخيصي و يا اهداف درماني در سرطان سرويكس در نظر گرفته شوند. مطالعه حاضر با هدف استفاده از آناليزهاي بيوانفورماتيكي براي شناسايي miRNA ها، ژن ها و مسيرهاي مربوط به آنها در اگزوزوم هاي مشتق شده از سلول سرطاني سرويكس انجام شد. روش‌كار: در اين مطالعه، بيان miRNAها و mRNAهاي اگزوزومي در سلول هاي هلا و سالم با آناليز داده‌هاي به‌دست آمده از پايگاه GEO براي miR-seq و RNA-seq در نرم‌افزار  R(نسخه 4.2.1) بررسي شد. پس از آن ژن‌هاي مشترك ميان هدف هاي miRNA و mRNA با بيان كاهشي يا افزايشي، از اگززوم ها انتخاب شدند و سپس آناليزهاي GO و مسيرهاي KEGG انجام شد. در پايان، ژن هاي مشترك براي ايجاد شبكه ميانكنش پروتئين-پروتئين و انتخاب ژن هاي كليدي مورد استفاده قرار گرفتند. يافته ها: در مطالعه حاضر، 31 miRNA با افزايش بيان و 16 miRNA با كاهش بيان در اگزوزوم ها مشاهده شد. همچنين 341 ژن مشترك از هدف هاي miRNA و RNA-seq براي آناليزهاي بعدي انتخاب شدند. آناليز GO نشان داد كه ژن هاي مشترك به‌طور معناداري در انتقال لوسين، فعاليت فسفاتازي MAP كيناز و انتقال گلوتامين نقش دارند. آناليز KEGG نيز پيش بيني كرد كه ژن ها در پيري سلولي، مسير پيام رساني p53 و سيكل سلولي به‌صورت معناداري نقش دارند. 10 ژن كليدي شامل CCNB1، BUB1، KIF20A،MKI67، FOXM1، BIRC5، NCAPH، ZWINT، GINS2 و ASF1B از شبكه ميانكنش پروتئين-پروتئين شناسايي شدند. نتيجه گيري: نتايج شامل شناسايي miRNAهاي با تغيير بيان و مشخص كردن ژن هاي كليدي در اگزوزوم هاي مشتق شده از سلول هاي سرطاني سرويكس بود. اين مطالعه مي تواند ديدگاه جديدي را براي تعيين مكانيسم هاي بالقوه همراه با اگزوزوم هاي مشتق شده از سلول هاي سرطاني در پيشرفت سرطان سرويكس ارائه كند.