تنوع توالي سيتوكروم-b ژنوم ميتوكندي در اسبهاي كرد ايران

بررسي توالي نوكلئوتيدي ناحيه سيتوكروم-b ژنوم ميتوكندري در درون جمعيت‌ها مي‌تواند شاخص مناسبي از ميزان تنوع موجود در جمعيت مورد مطالعه باشد. تحقيق اخير به منظور بررسي تنوع ژنتيكي در اسب كرد و رابطه فيلوژنتيكي اسب كرد با ساير نژادهاي اسب در دنيا با استفاده از ناحيه سيتوكروم-b انجام شد. بدين منظور از 30 رأس اسب نژاد كرد خون‌گيري بعمل آمد و DNA آن به روش نمكي استخراج گرديد، سپس با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي ناحيه سيتوكروم-b به طول 1029جفت باز تكثير و تمام نمونه‌ها بعد از خالص‌سازي توالي‌يابي شدند. قطعه مورد نظر پس از توالي‌يابي، با نرم‌افزار BioEdit  ويرايش و قطعة 882 جفت بازي از آن استخراج شد. نمونه‌ها با توالي مرجع اسب به شماره دسترسي (X79547) با استفاده از رويه Clustal-W همرديف شدند. تعداد هاپلوتيپ، جايگاههاي نوكلئوتيدي متغير، تنوع هاپلوتيپي و تنوع نوكلئوتيدي با استفاده از نرم افزار DNASP4.0 تعيين شد. درخت فيلوژني با استفاده از نرم افزار MEGA6.1 به روش Neighbour-joining ترسيم شد. تعداد 7 هاپلوتايپ با 7 جايگاه نوكلئوتيدي متغير شناسايي شد. هاپلوتايپهاي بدست آمده همگي در هاپلوگروه K قرار گرفتند. ميزان تنوع هاپلوتيپي و نوكلئوتيدي به ترتيب 0.001±0.784 و 0.001±0.00218 برآورد شد. تركيب نوكلئوتيدها در توالي شاخص شامل 21.27% نوكلئوتيد A، 32.77% نوكلئوتيد C، 13.15% نوكلئوتيد G و 26.87% نوكلئوتيد  Tبود. بر اساس نتايج آناليز فيلوژني، اسب كرد از نظر ژنتيكي به نژادهايي از ژاپن، چين ، نژادي از لهستان و عربستان نزديكتر است، كه نشان دهنده تشابه ژنتيكي بيشتر اسب كرد با نژادهاي آسيايي و تا حدودي اروپايي مي‌باشد..