بررسي تفاوت هاي سيستم گاباارژيك هيپوتالاموس مرغ هاي تخم گذار تجاري لگهورن سفيد و مرغ بومي براساس داده هاي RNA-Seq

هدف: گابا اسيد آمينه ي غير پروتئيني است كه از دكربوكسيله شدن گلوتامات توسط آنزيم گلوتامات دكربوكسيلاز بدست مي آيد. سيستم عصب مركزي مملو از اين اسيدآمينه مي باشد، كه به عنوان نورترانسميتر اصلي مهاري در مغز عمل ميكند. اثر بيولوژيك گابا بواسطه گيرنده هاي A,Bو C رخ مي دهد كه نوع A يونوتروپيك و دو نوع ديگر متابوتروپيك مي باشند. وضعيت بيان ژنهاي مسير گاباارژيك در شرايط فيزيولوژيك مختلف متفاوت مي باشد. يكي از اين شرايط كرچي در طيور است كه بررسي تحول اين مسير در وضعيت مرغ هاي با كرچي زياد و بدون كرچي به كشف آن كمك خواهد كرد. مواد و روش ها:ابتدا داده هاي مربوطه از پايگاه NCBI با شماره دسترسي DRA008396 در فرمت SRA دانلود گرديدند. در ادامه براي بررسي كيفيت داده ها از نرم افزار FastQC و براي ترميم داده ها و حذف آداپتورها از نرم افزار Trimmomatic استفاده گرديد. از وبسايت هستي شناسي براي تعيين مسيرهاي متابوليكي ژنها و از نرم افزار STRING در جهت رسم شبكه ژني و ژنهاي هاب استفاده شد. نتايج: در هيپوتالاموس مرغ هاي لگهورن غير كورچ و مرغهاي بومي كرچ 2943 ژن بيان شده مشاهده شد. كه پس از آناليز مسير 7ژن مرتبط با مسيرهاي گاباارژيك شناسايي شدند. اين ژنها شامل آنزيم هاي تبديل كننده گلوتامات به گابا دو نوع مي باشند كه GAD1 و GAD2 مي باشد .هر دوي اين آنزيم ها در مرغ هاي بومي كرچ در مقايسه با مرغ لگهورن كاهش بيان را نشان داد. گيرنده گابا A و G وB به طور معني داري كاهش و گيرنده گابا نوع A زيرواحد Pi و گيرنده C زيرواحد R1 افزايش بيان در مرغ هاي بومي دچار كرچي نسبت به مرغ لگهورن در دادهاي ترانسكريپتوم مشاهده شدند. نتيجه گيري: از بررسي مقايسات ترانسكريپتوم مسير گاباارژيك هيپوتالاموس ميان مرغ لگهورن و مرغ بومي تفاوت معني دار گيرنده ها، آنزيم هاي سنتز كننده گابا مشاهده گرديد. در مرغ هاي تخم گذار گابا و گيرنده هاي آن بيان ژن بالايي دارند و احتمالاً از بررسي مسير گاباارژيك در مراحل مختلف دوره توليد مرغ هاي تخم گذار مشاهدات قابل توجهي متبادر خواهد شد.