شناسايي ژن‌هاي موثر جديد در پيشبرد مقاومت به اريترومايسين در كمپيلوباكتر ژژوني با بهره‌گيري از ابزار بيوانفورماتيكي

آنتي‌بيوتيك‌هاي ماكروليد براي درمان عفونت‌هاي ناشي از كمپيلوباكترژژوني مهم هستند. ايجاد مقاومت در برابر اين دسته از آنتي‌بيوتيك‌ها در كمپيلوباكتر فرايندي پيچيده توام با تغييرات مولكولي پويا است كه به خوبي تعريف نشده‌اند. در پژوهش حاضر براي پركردن جاي خالي موجود در ارتباط با ايجاد مقاومت آنتي‌بيوتيكي به درمان با اريترومايسين، پاسخ ترنسكريپتوميك كمپيلوباكترژژوني سويه‌ي 11168 NCTC به درمان با اريترومايسين (ERY) با روش ميكرواري تعيين شد. داده‌هاي به‌دست‌آمده شناسايي، استخراج و با ابزارهاي آنلاين GEO2R و نرم‌افزارR آناليز شدند. ژن‌هاي با بيشترين بيان افتراقي با استفاده پارامترهاي p 0.05 و |1 |LogFC شناسايي شدند. سپس، بيان ژن‌هاي مرتبط جدا و براي ژن‌هاي با افزايش بياني، توسط پايگاه‌ داده STRING شبكه پروتئيني در نظر گرفته ‌شد و با نرم‌افزار  Cytoscapeرسم شد. با شناسايي ژن‌هاي مختلف با كاهش و يا افزايش بيان معنادار، مشخص شد مجموعه‌اي از ژن‌هاي flaA, flaB, flgB, CmeC, sdhA, sdhB مي‌توانند در مقاومت آنتي‌بيوتيكي كمپيلوباكتر ژژوني نسبت به درمان با آنتي‌بيوتيك اريترومايسين نقش داشته ‌باشند. در اين مطالعه با بررسي اهداف، اثرگذاري و آناليز عملكردي اين ژن‌ها، راهكارهاي مناسبي براي مهار مقاومت ارائه‌ گرديد.