مطالعه پويش كل ژنومي بر پايه آناليز مسير مرتبط با صفات تعداد كل بره متولد شده و سن اولين زايش در گوسفندان چند قلوزا

مقدمه و هدف: بررسي معماري ژنتيكي صفات توليدمثلي به‎دليل اين‎كه تأثير عمده‎اي بر سيستم‎هاي توليدي در صنعت گوسفنداري دارد، مورد توجه محققين قرار گرفته است. هدف پژوهش حاضر، شناسايي مناطق ژنومي مؤثر بر تعداد كل نتاج متولد شده و سن اولين بره‎زايي ميش‎هاي نژاد پربازده كاياس با استفاده از آرايه هاي ژنومي 50K بود. مواد و روش‎ها: در اين تحقيق، از اطلاعات ژنوتيپي و فنوتيپي 538 رأس از ميش‌ هاي با باروري بالا شامل تعداد كل بره متولد شده در طول عمر و سن اولين زايش استفاده شد. آناليز در سه مرحله شامل تعيين مكان SNPهاي معني دار با ژن، ارتباط ژن‌ ها به طبقات عملكردي و مسيرهاي بيوشيميايي و در ادامه آناليز همبستگي بين هر يك از مسيرهاي عملكردي با صفات فنوتيپي مورد نظر انجام گرفت. ارزيابي پويش ژنومي براي صفات توليد مثلي در نرم‌ افزار GEMMA انجام شد و سپس با استفاده از بسته نرم‎افزاري biomaRt2 برنامه R ژن هاي معني داري كه در داخل و يا 15 كيلوباز بالا و پايين‎دست نشانگرهاي معني‌ دار قرار داشتند، شناسايي شدند. در نهايت، آناليز غني‌ سازي مجموعه‌ هاي ژني با برنامه برخط KOBAS با هدف شناسايي عملكرد بيولوژيكي ژن هاي نزديك به مناطق انتخابي از طريق پايگاه‌ هاي برخط GO، KEGG، Reactome، BioCyc و PANTHER انجام شد.يافته‌ ها: در اين پژوهش تعداد 11 نشانگر تك نوكلئوتيدي روي كروموزوم ‌هاي 1، 2، 5، 7، 8، 10، 13، 15، 17، 22 و 23 شناسايي شدند. در اين مناطق ژن هاي QULP1،AURKA،TEX12،DLG1T،ACVR1، LCP2 و PPFIA2 كه با صفات توليدمثلي در ارتباط هستند، قرار داشتند. برخي از اين ژن هاي شناسايي شده در اين تحقيق با مطالعات قبلي هم‎خواني داشتند. در تحليل غني‌ سازي مجموعه‌ هاي ژني، تعداد 19 مسير بيولوژيكي مرتبط با صفات توليد مثلي شناسايي شدند. برخي از مسيرهاي زيستي شناسايي شده در باروري، نرخ تخمك‎اندازي، بيوسنتز استروژن، نرخ آبستني، رشد و توسعه عضلات اسكلتي، رشد ابتدايي جنين و سن بلوغ نقش مهمي دارند. نتيج‌هگيري: ‎ نتايج حاصل از اين تحقيق مي تواند نقش مكانيسم‌هاي ژنتيكي موثر بر صفات توليد مثلي بيشتر آشكار سازد. با توجه به تأييد مناطق قبلي پويش ژنومي و نيز شناسايي مناطق ژنومي جديد در اين مطالعه، مي توان با اطمينان بيشتراز يافته ‎هاي اين پژوهش در برنامه‌هاي اصلاح نژادي براي صفات اقتصادي مهم در گوسفند استفاده نمود.