مطالعه پويش كل ژنوم بر پايه غني سازي مجموعه هاي ژني صفات مهم اقتصادي در بلدرچين ژاپني

در اين پژوهش، به منظور شناسايي ژن ها و مسيرهاي مرتبط با برخي صفات اقتصادي، مطالعه پويش كل ژنوم بر مبناي تجزيه غني سازي مجموعه هاي ژني با استفاده از يك تراشه چندشكلي تك نوكلئوتيدي (SNP) ژنوم بلدرچين ژاپني ( illumina iSelect 4K) در يك جمعيت F2 حاصل از تلاقي دوطرفه انجام شد. به ازاي هر پرنده، صفات ميزان خوراك مصرفي، افزايش وزن بدن، ضريب تبديل خوراك، خاكستر استخوان درشت ني و پا اندازه گيري شد. با استفاده از نرم افزار GCTA و بر اساس مدل خطي مختلط ارتباط هر يك از SNP ها با هر يك از صفات بررسي شد. تجزيه غني سازي مجموعه هاي ژني با بسته نرم افزاري goseq برنامه R با هدف شناسايي طبقات عملكردي و مسيرهاي زيستي ژن هاي نزديك در مناطق ژنومي كانديدا انجام شد و در نهايت براي تجزيه بيوانفورماتيكي از پايگاه هاي برخط DAVID و PANTHER استفاده شد. در اين پژوهش، تعداد 11 نشانگر SNP واقع روي كروموزوم هاي 2، 3، 4، 5، 10، 18، 20، 24 و 27 شناسايي شدند كه با ژن هاي NPY، DRD2، PTPRN2، BMPR1B، MYF5، IGF2BP1، MYO1E، FGF2، LDB2، BMP4، ACOX1، PCK1، PLCB4، PLCB1 و PLCG1 مرتبط بودند. در تجزيه غني سازي مجموعه ژني، تعداد 23 طبقات هستي شناسي و مسيرهاي بيوشيميايي KEGG با صفات مورد بررسي شناسايي شد (0.05 P). از اين بين، طبقات هستي شناسي Protein glycosylation، Myoblast differentiation،Positive regulation of muscle cell differentiation ، مسيرهاي بيوشيميايي MAPK signaling pathway و Calcium signaling pathway نقش مهمي در توسعه الياف عضلاني اسكلتي، مصرف خوراك و قابليت جذب داشتند. با توجه به تأييد مناطق قبلي پويش ژنومي و شناسايي مناطق ژنومي جديد، استفاده از يافته هاي اين پژوهش مي تواند در انتخاب ژنتيكي با هدف بهبود توليد، مفيد باشد.