آشكارسازي پاسخ به عفونت آنفلوانزاي H5N1: تجزيه و تحليل مقايسه اي شبكه هاي بيان ژن و مسيرهاي غني شده عملكردي در جوجه ها و اردك ها

درك ساز و كارهاي مولكولي پاسخ ميزبان به عفونت H5N1 براي گسترش اقدامات كنترل موثر و كاهش خطر يك بيماري همه گير بالقوه بسيار مهم است. هدف مطالعه حاضر، تجزيه داده هاي ريزآرايه آنفلوانزاي فوق حاد پرندگان H5N1 جهت مقايسه شبكه ژني در جوجه ها و اردك ها بود. مجموعه داده ريزآرايه GSE33389 مشتمل بر نمونه شاهد و زير چالش H5N1 بافت ريه جوجه و اردك با بسته GEOquery نرم افزار R دانلود شد. ژن‌هاي با بيان متفاوت با استفاده از بسته limma در نرم‌افزار R شناسايي شدند و سپس، ترسيم شبكه‌هاي ژني با نرم افزار Cytoscape انجام شد. ژن‌هاي اصلي با تعاملات زياد با افزونه Cytohubba شناسايي شدند و در نهايت، ماژول‌هاي اثرگذار با افزونه MCODE شناسايي شدند. تعداد 2062 و 565 ژن با بيان متفاوت بين بافت سالم و زير چالش به ترتيب در جوجه‌ها و اردك‌ها شناسايي شدند (05/0P و 2 |logFC|). نتايج تجزيه شبكه با استفاده از افزونه Cytohubba، ژن هايBUB1 ، NDC80، CDC20 را به عنوان ژن هاي هاب در جوجه و همچنين ژن هاي كليدي COL6A3، COL3A1 و PLOD2 را در اردك شناسايي نمود (05/0P ). مقايسه هستي شناسي ژن‌هاي متفاوت بيان شده در جوجه و اردك نشان داد كه بيشتر آن ها در جوجه ها در پاسخ ايمني ذاتي و مقاومت‌هاي التهابي ميزبان نقش دارند، ولي در اردك بيشتر در سوخت و ساز چربي و توليد انرژي براي تامين نيازمندي مقاومت ميزبان در برابر بيماري نقش ايفا مي‌كنند. يافته‌هاي اين مطالعه ضمن افزايش آگاهي نسبت به چگونگي پاسخ ميزبان به عفونت آنفلوانزاي H5N1، ممكن است دستاوردهايي براي توسعه درمان هدفمند و راهبردهاي نظارتي براي مبارزه موثر با شيوع H5N1 داشته باشد.