شناسايي ژن‌هاي عامل سرطان در شبكه ژني با استفاده از معماري شبكه عصبي پيش‌خور

شناسايي ژن‌هاي آغازگر سرطان يا عامل سرطان يكي از موضوعات تحقيقاتي مهم در زمينه سرطان‌شناسي و زيست‌داده‌ورزي است. ژن‌هاي عامل سرطان، ژن‌هايي هستند كه بعد از اينكه جهش در آنها اتفاق مي‌افتد، آن جهش را از طريق برهم‌كنش‌هاي پروتئين- پروتئين به ديگر ژن‌ها منتقل كرده و از اين طريق، باعث اختلال در عملكرد سلول و بروز بيماري و سرطان مي‌شوند. تا كنون روش‌هاي مختلفي براي پيش‌بيني و دسته‌بندي ژن‌هاي عامل سرطان پيشنهاد شده كه اكثراً متكي به داده‌هاي ژنومي و ترنسكريپتوميك هستند و از اين رو ميانگين هارمونيك پاييني در نتايج دارند. تحقيقات در اين زمينه به‌منظور بهبود دقت نتايج ادامه دارد و از اين رو روش‌هاي مبتني بر شبكه و زيست‌داده‌ورزي به كمك اين حوزه آمده‌اند. در اين مطالعه ما رويكردي را پيشنهاد داده‌ايم كه متكي به داده‌هاي جهش نيست و از روش‌هاي شبكه‌اي براي استخراج ويژگي و از شبكه عصبي سه‌لايه پيش‌خور براي دسته‌بندي ژن‌ها استفاده مي‌كند. براي اين منظور، ابتدا شبكه زيستي مورد نظر كه شبكه تنظيم رونويسي سرطان سينه است، تشكيل و سپس ويژگي‌هاي مختلف هر ژن به‌صورت بردارهايي استخراج گرديد. نهايتاً بردارهاي به‌دست‌آمده جهت دسته‌بندي به يك شبكه عصبي پيش‌خور داده شد. نتايج به‌دست‌آمده نشان مي‌دهند كه استفاده از روش‌هاي مبتني بر شبكه‌هاي عصبي چندلايه مي‌تواند صحت و ميانگين هارمونيك را بهبود بخشد و باعث بهبود عملكرد نسبت به ساير روش‌هاي محاسباتي شود.