شماره ركورد
1376101
عنوان مقاله
شناسايي خانواده ژني پروتئينفسفاتاز 2C (AlPP2C) در گياه شوردوست آلوروپوس ليتوراليس
پديد آورندگان
هاشمي پطرودي ، حميدرضا دانشگاه علوم كشاورزي و منابع طبيعي ساري - پژوهشكده ژنتيك و زيستفناوري كشاورزي طبرستان , محمدي ، سميرا مؤسسه ژنتيك گياهي و تحقيقات گياهان زراعي ليبنيز (IPK) - گروه ژنتيك مولكولي , بخشنده ، اسماعيل دانشگاه علوم كشاورزي و منابع طبيعي ساري - پژوهشكده ژنتيك و زيست فناوري كشاورزي طبرستان , كولمن ، ماركوس موسسه ژنتيك گياهي و تحقيقات گياهان زراعي ليبنيز (IPK) - گروه ژنتيك مولكولي
از صفحه
37
تا صفحه
53
كليدواژه
بيان ژن , تنش شوري , تنش غيرزنده , پيامرساني , هالوفيت
چكيده فارسي
پروتئين فسفاتازهاي (PP2Cs) 2C، نقشي كليدي در بيان ژنهاي پاسخگو به تنش از موجودات پست پروكاريوتي تا يوكاريوتهاي عالي ايفا مينمايند. در اين مطالعه، بررسي بيوانفورماتيكي اعضاي خانواده ژني PP2C به منظور شناسايي و تجزيه و تحليل ژنهاي اورتولوگ مرتبط با تنش در ژنوم گياه هالوفيت علفي يكلپه Aeluropus littoralis انجام شد. در مجموع 34 ژن AlPP2C بر اساس ساختار اختصاصي دمين PP2C، در ژنوم اين گياه شناسايي گرديد. در درخت فيلوژنتيكي ترسيم شده از پروتئينهاي AlPP2C همراه با پروتئينهاي thaliana Araboidopsis، پروتئينهاي AlPP2C و AtPP2C در ده گروه مختلف بر مبناي همولوژي طبقهبندي شدند. تجزيه و تحليل موتيفهاي حفاظتشده پروتئينهاي خانواده AlPP2C نشان داد كه گروهبندي فيلوژنتيكي از تطابق بالايي با الگوي پراكنش موتيفهاي هر گروه داشت. تجزيه و تحليل ساختار اگزون اينترون توالي ژني نشان داد كه اعضاي اين خانواده به لحاظ آرايش و فراواني اگزونها از الگوي متفاوتي برخوردارند. شناسايي و طبقهبندي عناصر تنظيمي سيس در هشت گروه مختلف صورت گرفت كه از مهمترين عناصر سيس مرتبط به تنش ميتوان به موتيفهاي ABRE،MBS ،DRE ، STRE و LTR اشاره نمود. بررسي الگوي ترانسكريپتوم (RNA Seq) نشان داد كه ژنهاي AlPP2C الگوهاي بيان متفاوتي در پاسخ به تنش شوري و شرايط بازيابي در دو بافت برگ و ريشه ارائه نمودند كه احتمالا بيانگر مسيرهاي تنظيمي متفاوت در بيان اين ژنهاست. الگوي بيان مشاهده شده ژن AlPP2C4 در بافت ريشه، حاكي از تنظيمات بيان بافت اختصاصي اين ژن ميباشد. اين تحقيق با شناسايي ژنهاي اورتولوگ PP2C مرتبط با تنش در گياه آلورورپوس ليتوراليس، اطلاعات ارزشمندي را براي مطالعات عملكرد ژني و فرايندهاي بيولوژيكي ژنهاي PP2C فراهم ميآورد.
عنوان نشريه
زيست فناوري گياهان زراعي
عنوان نشريه
زيست فناوري گياهان زراعي
لينک به اين مدرک