بررسي مقايسه‌اي خانواده ژني CCCH Zinc finger در آرابيدوپسيس تاليانا و برنج

ژن‌هاي خانواده زينك‌فينگر CCCH (C3HZNF)، كد كننده پروتئين‌هايي با سه سيستئين و يك هيستيدين مي‌باشند. پروتئين‌هاي اين خانواده دسته مهمي از فاكتورهاي رونويسي زينك فينگر بوده كه در فعاليت‌هاي مختلف از جمله رشد و نمو گياه و پاسخ به تنش‌هاي زيستي و غير زيستي و در واقع در مقاومت به تنش‌ها موثر مي‌باشند. در اين مقاله از داده‌هاي پروتئيني C3HZNF دو گياه آرابيدوپسيس و برنج براي تجزيه و تحليل روابط فيلوژنتيك، ساختار اگزون/ اينترون، سازماندهي موتيف‌ها/ دامنه ها استفاده شد. اين بررسي‌ها نشان از همولوژي بالاي اين ژن‌ها با ژن‌هاي CCCH در برنج داشتند. تجزيه و تحليل ساختار ژني نشان داد كه AtC3Hها داراي تعداد اگزون‌هاي متغيري مي‌باشند، اما به طور كلي ژن‌هايي با 1 و 7 اگزون، بيشترين تعداد را در بر مي‌گيرند. بررسي ويژگي‌هاي فيزيكي و شيميايي پروتئين‌هاي اين خانواده نشان داد كه AtC3H36 پايدارترين پروتئين در بين اعضاي اين خانواده مي‌باشد همچنين بيشترين نقطه ايزوالكتريك متعلق به پروتئين AtC3H7 (96/9) است. مشاهدات نشان داد اعضاي اين خانواده ژني داراي 1 تا 6 دمين Znf C3H و مجموعا 17 دمين عملكردي مي‌باشند. مقايسه‌ي فيلوژني بين پروتئين‌هاي C3H در برنج و Arabidopsis نشان داد كه اين پروتئين‌‌ها از حفاظت شدگي بالايي برخوردارند. در آناليز فيلوژنتيكي مقايسه‌اي AtC3H وOsC3H، ژن‌هاي اورتولوگ در يك گروه‌ قرار گرفتند. به عنوان مثال،OsC3H8 همولوژي نزديكي با HUA1 در Arabidopsis (AtC3H37) نشان داد، كه اين ژن در توسعه گل نقش دارد. اين مطالعه اطلاعات ارزشمندي در مورد خانواده مهم ژني CCCH zinc finger در گياه آرابيدوپسيس و برنج ارائه مي‌دهد. اين اطلاعات مي‌تواند در درك نحوه عمل اين ژن‌ها براي كمك به مقاومت گياه در هنگام مواجه با تنش هاي زيستي و غير زيستي كمك كننده باشد.