شماره ركورد
1377591
عنوان مقاله
بررسي تنوع اهداف فاژي و پلاسميدي سيستم CRISPR/Cas در جنس لوكونوستوك با استفاده از رويكرد In-silico
پديد آورندگان
غفاريان ، سارا دانشگاه شهيد مدني آذربايجان - دانشكده علوم پايه - گروه زيست شناسي , پناهي ، بهمن سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - پژوهشگاه بيوتكنولوژي كشاورزي ايران (ABRII)، پژوهشكده بيوتكنولوژي شمال غرب و غرب كشور(AREEO) - گروه ژنوميكس
از صفحه
15
تا صفحه
36
كليدواژه
جنس Leuconostoc , سيستم ايمني تطبيقي , تنوع ژنتيكي , تكامل
چكيده فارسي
باكتريهاي جنس Leuconostoc جزئي از ميكروفلور طبيعي اغلب مزارع كشاورزي و محصولات تخميري هستند. آلودگي توسط انواع دي.ان.اي مهاجم خارجي منجر به شكست فرآيند تخمير ميشود. سيستم CRISPER/Cas از اجزاي اصلي سيستم ايمني باكتريها است. در اين مطالعه مسير تكاملي سويههاي مختلف جنس لوكونوستوك بر مبناي وقايع تركيب، حذف و اضافهشدگي تواليهاي فاصلهانداز تحت شرايط فشار انتخابي ارزيابي و تنوع فاژها و پلاسميدهاي مهاجم هدف قرار داده شده توسط سيستم CRISPER/Cas سويههاي جنس Leuconostoc مطالعه شد. بيشترين تشابه از نظر تركيب توالي تشكيلدهنده فاصلهاندازها و وقايع اضافهشدگي و حذف در فاصلهاندازها در دو گونه Leuconostoc pseudomesentriodes و Leuconostoc gelidum مشاهده شد. تعداد 45 فاصلهانداز از سويه AMKR21 گونه L. gelidum فاژ Alteromonas phage JH01 را هدف قرار دادند كه بيشترين ميزان تطابق با فاژها بود. همچنين بيشترين تعداد انواع فاژ داراي تطابق، مربوط به فاژهاي Escherchia phage بود. در مورد هدفگيري پلاسميدهاي مهاجم، 177 مورد هدفگيري پلاسميدهايي از Leuconostoc citreum توسط سويه NBRC113246 گونه L. gelidum شناسايي شد كه بيشترين ميزان مطابقت در بين سويههاي مختلف بود. نتايج اين مطالعه اهميت سيستمهاي ايمني تطبيقي باكتريايي در پايداري در محيطهاي حاوي باكتريوفاژ و نيز بهرهبرداري از اين اطلاعات در تعريف فرمولاسيونهاي كاربردي را آشكار كرد.
عنوان نشريه
ايمني زيستي-انجمن ايمني زيستي ايران
عنوان نشريه
ايمني زيستي-انجمن ايمني زيستي ايران
لينک به اين مدرک