آناليز بيوانفورماتيكي خانواده ژني ‏MYB‏ در گستره ژنوم تك‌لپه‌اي‌ها و دولپه‌اي‌ها

ابرخانواده عامل رونويسي MYB در رشد و نمو گياه، فعال‌سازي ژن‌هاي پاسخ‌دهنده به تنش و در مواردي بيوسنتز متابوليت‌هاي كليدي نقشي اساس دارند. در دسترس بودن توالي‌هاي ژنومي سيب‌زميني، آرابيدوپسيس، ذرت و جو اين فرصت را فراهم كرد تا به‌ترتيب 121، 139، 190 و 144 ژن MYB غيرتكراري در ژنوم اين گياهان شناسايي شود. در بررسي خصوصيات تكاملي، دامنه‌هاي حفاظت‌شده‌ي MYB در دو گياه تك‌لپه‌اي ذرت و جو از نظر همرديفي و ترتيب قرار گرفتن، شباهت چشمگيري با يكديگر داشتند. اين خصوصيت در رابطه با دو گياه دولپه‌اي سيب‌زميني و آرابيدوپسيس نيز صادق بود ولي تفاوت دامنه‌هاي حفاظت‌شده‌ي MYB در تك‌لپه‌اي‌ها و دولپه‌اي قابل‌توجه بود. اعضاي 2R-MYB رايج‌ترين زيرگروه از خانواده‌ي MYB در گياهان تك‌لپه‌اي و دولپه‌اي بودند و فقط يك عضو از زيرخانواده 4R-MYB در ذرت مشاهده شد. در هر چهار گياه دليل اصلي تمايز عملكردي ژن‌ها در اين خانواده‌ي ژني segmental duplication بود كه منجر به گزينش تكاملي مثبت و منفي گرديده است. خانواده‌ي ژني MYB روي تمامي كروموزوم‌هاي سيب‌زميني، آرابيدوپسيس، ذرت و جو با پراكنش غيريكنواخت قرار گرفته‌اند. وجود عناصر تنظيمي همسو متنوع و متعدد پاسخ به تنش‌ها و هورمون‌ها در ناحيه‌ي راه‌انداز ژن‌هاي MYB و بررسي پروفايل‌هاي بياني اين خانواده ژني در تنش‌هاي زيستي و غيرزيستي در آرابيدوپسيس دلالت بر تنوع كاركردي ژن‌هاي اين ابرخانواده دارد. بررسي بيوانفورماتيكي ابرخانواده ژني MYB در تك‌لپه‌اي‌ها و دولپه‌اي‌ها چارچوبي براي مطالعات مقايسه‌اي، تكاملي و عملكردي اعضاي اين ابرخانواده‌ي ژني مهم فراهم مي‌كند.