تجزيه و تحليل بيوانفورماتيك خصوصيات فيزيكوشيميايي، تغييرات پس ‌ترجمه‌اي و دميني ‏پروتئين ‌هاي درگير در تحمل شوري گندم ‏

شوري يكي از مهم‌ترين تنش ‌هاي محيطي است كه باعث اختلال در رشد طبيعي گياهان مي‌شود. گياه براي مقابله با شرايط تنش‌زا، از جمله تنش شوري مكانيسم‌هاي مختلفي را به كار مي‌گيرد كه از مهم‌ترين آنها در سطح مولكولي، تغيير در بيان پروتئين‌ها است. تغيير بيان پروتئين‌ها در گرو تغييرات فيزيكوشيميايي آنها مثل نيمه عمر، شاخص پايداري، نقطه ايزوالكتريك، وزن مولكولي و ضريب خاموشي است. در اين پژوهش تعدادي از پروتئين‌هاي داراي تغيير بيان تحت تنش شوري در گندم براي تجزيه و تحليل‌هاي بيوانفورماتيكي استفاده شده است. از بين 25 پروتئين مرتبط با تنش شوري مورد مطالعه، تعداد 20 پروتئين داراي نيمه عمر بيشتر از 20 ساعت بودند. وزن مولكولي اين پروتئين‌ها بين 13 تا 117 كيلو دالتون بوده و 15 پروتئين شاخص ناپايداري كمتر از 40 داشته و پايدار برآورد شدند. از بين پروتئين‌هاي درگير در تنش شوري گندم α- توبولين به عنوان يك مونومر به همراه - توبولين در يك دايمر به نام α- توبولين شركت مي‌كند. توبولين، بخش عمده ميكروتوبول‌ها را ايجاد مي‌كند كه براي رشد و تقسيم سلولي ضروري‌اند. اين پروتئين داراي يك الگو به نامTubulin subunits alpha, beta and gamma signature و يك دمين به نام PLN00221 مي‌باشد. براي پروتئين تريوزفسفات‌ايزومراز، دميني با نام TIM- like beta/ alpha barrel domains كه در مكانيسم كاتاليزوري نقش دارد و براي پروتئين كالمودولين يك دمين به نام PTZ00184 شناسايي شد كه دمين متصل شونده به كلسيم مي‌باشد. براي پروتئينPutative glycine decarboxylse subunit دميني به نام PRK01202 شناسايي شد كه فعاليت كربوكسيلازي دارد. براي پروتئين 2-Cys proxiredoxin BAS 1 دمين PRX- Typ 2 cys شناسايي شد كه نقش مهمي در تنظيم اكسيداسيون- احياي سلولي دارد. اين پژوهش نشان داد كه تنش شوري طيف وسيعي از پروتئين‌هاي با ويژگي‌هاي فيزيكي و شيميايي بسيار متفاوت از هم را در بر مي‌گيرد و شامل پروتئين‌هاي با وزن مولكولي سنگين و سبك، پايدار و ناپايدار، داراي نيمه عمر طولاني و كوتاه و داراي نقطه ايزوالكتريك متفاوت از هم مي‌شود.