مطالعه ارتباط ژنومي براي شناسايي ژن‌هاي كانديدا در مراحل اوليه رشد در مرغ

تاكنون روش هاي متعددي براي شناسايي فاكتورهاي ژنتيكي مؤثر بر صفات پلي ژنيك مورداستفاده قرارگرفته است. روش‌هاي رايج استفاده‌شده شامل آناليز رگرسيوني مبتني بر حداقل مربعات، آناليز رگرسيوني مبتني بر حداكثر درست نمايي و روش‌هاي بيزي مي‌باشد. از برتري روش‌هاي بيزين نسبت به ساير روش‌ها مي‌توان به امكان استفاده هم‌زمان از كل ماركرها در مدل اشاره نمود كه منجر به جلوگيري از بيش برآورد اثرات نشانگرها شده و احتمال شناسايي SNPهاي مثبت واقعي را افزايش مي‌دهد. ازاين‌رو، در مطالعه حاضر براي شناسايي SNPهاي مرتبط با وزن بدن در سنين اوليه (2 هفتگي)، در يك جمعيت F2 از مرغان آميخته، از روش بيز Cpi استفاده شد. سپس، براي تعيين ژنوتيپ جمعيت حاضر شامل 312 مرغ F2، چيپ‌هاي تجاريIllumina 60K  استفاده گرديد. درنهايت، 16 ماركر SNP كه داراي فاكتور بيز بين 20 تا 150 بودند، به‌عنوان ماركرهاي پيشنهادي براي وزن بدن در اين سن در نظر گرفته شد. اين SNPها بر روي 4 كروموزوم توزيع‌شده‌اند و به‌صورت سببي و يا به‌واسطه وجود عدم تعادل پيوستگي با 16 ژن ارتباط نزديك دارند. از ژن هاي شناسايي‌شده 12 ژن، كد كننده پروتئين و 4 ژن RNA غيركدكننده مي‌باشند. براي شناسايي ژن‌هاي مرتبط با هر SNP در مناطق كانديدا، Mb 5/0 اطراف هر SNP معني دار در نظر گرفته شد.