عنوان مقاله :
رديابي و تعيين خصوصيات بيولوژيكي و فيلوژنتيكي ويروس Y سيب زميني (PVY) جدايه استان لرستان
پديد آورندگان :
رحيمي ، فاطمه دانشگاه آزاد اسلامي واحد خرم آباد - گروه بيماري شناسي گياهي , وفايي ، حسين دانشگاه آزاد اسلامي واحد خرم آباد - گروه بيماري شناسي گياهي , پاكباز ، سميرا دانشگاه لرستان - دانشكده كشاورزي - گروه گياهپزشكي
كليدواژه :
پوشش پروتئيني , توالي يابي , خرم آباد , سيب زميني , Potyvirus
چكيده فارسي :
بيماري هاي ويروسي از جمله عوامل محدود كننده توليد سيب زميني در جهان هستند. ويروس Y سيبزميني (PVY) گونه جنس Potyvirus از خانواده Potyviridae يكي از مهمترين بيماريهاي محصول سيبزميني ميباشد. به منظور رديابي ويروس، تعداد 135 نمونه از گياهاني كه علائم موزائيك، كوتولگي، موجي بودن حاشيه برگ، لكههاي كلروتيك و تغيير شكل برگ را نشان ميدادند، از مزارع سيبزميني استان لرستان جمعآوري گرديد. عصاره گياهان مشكوك در مرحله چهار برگي روي گياهان محكNicotiana glutinosa ، N. occidentalis وN. debneyi مايهزني گرديد. پس از حدود ده روز علايمي نظير زردي موضعي، رگبرگروشني و موزائيك روي N. occidentalis و پيسه اي شدن و نكروز موضعي روي N. glutinosa مشاهده شد. از گياهان محك داراي علائم، استخراجRNA كل صورت گرفت و با استفاده از آزمون RT-PCR و آغازگرهاي اختصاصي مربوط به بخشي از ناحيه ژنومي ژن CP و NIb ويروسPVY ، باندي در محدوده bp 1115 تكثير شد و آلودگي نمونهها به ويروس PVY اثبات شد. بررسيهاي فيلوژنتيكي نشان داد كه جدايه ايراني مورد مطالعه داراي 48/99-74/98 درصد همساني ژنتيكي با ديگر تواليهاي ثبت شده در اين ناحيه درNCBI بود. نتايج تجزيه و تحليلهاي ژنتيكي نشان داد كه جدايههاي ويروس PVY در دو گروه قرار گرفتند و جدايه رديابي شده از استان لرستان در گروه II و در كنار جدايههاي مربوط به كشور آلمان كه متعلق به نژاد Wilga بودند، قرار گرفت. توالي نوكلئوتيدي قطعه مورد نظر در NCBI به شماره دسترسي MT655949 ثبت گرديد. اين اولين گزارش از آلودگي مزارع سيبزميني استان لرستان به ويروسPVY به كمك آزمايشات مولكولي ميباشد.
عنوان نشريه :
پژوهش هاي سلولي و مولكولي
عنوان نشريه :
پژوهش هاي سلولي و مولكولي