عنوان مقاله :
شناسايي شبكه تنظيمي عمكردي miRNA-mRNA در سقط مكرر: آناليز بيوانفورماتيكي پرزهاي جفتي انساني
پديد آورندگان :
روحاني ، ياس دانشگاه شهركرد - دانشكده علوم پايه - گروه ژنتيك , رئيسي ، سميه دانشگاه شهركرد - دانشكده علوم پايه - گروه ژنتيك
كليدواژه :
سقط خودبهخودي مكرر , شبكه miRNA-mRNA , مسير هاي پيامرساني
چكيده فارسي :
مقدمه: سقط خودبهخودي مكرر (RSA)، يك اختلال توليدمثلي است كه مسئله حل نشدهاي را در زنان ايجاد ميكند. miRNAها ممكن است در تنظيم رشد جنين و حفظ بارداري نقش داشته باشند. مطالعه حاضر با هدف بررسي پروفايل miRNA در پرز جفتي زنان با سقط مكرر با مطالعات بيوانفورماتيكي انجام شد.روشكار: در اين مطالعه، پروفايل بياني mRNA و miRNA سلولهاي پرز جفتي از پايگاه GEO دريافت شدند. بعد از بهدست آوردن هدفهاي miRNAهاي داراي تغيير بيان، اشتراك اين هدف ها با mRNAهاي كاهشي/افزايشي بهدست آمد. در مرحله بعد هويتشناسي ژني (GO) و مسيرهاي KEGG، براي ژن هاي مشترك انجام شد. شبكه ميانكنش پروتئين- پروتئين و ژن هاي كليدي مورد بررسي قرار گرفت. در نهايت شبكه تنظيمي miRNA-mRNA رسم شد.يافته ها: تعداد 123 miRNA با تغيير بيان (16 عدد كاهش بيان و 107 عدد افزايش بيان) و 670 ژن با تغيير بيان (شامل 269 ژن كاهش بيان و 366 ژن با افزايش بيان) آناليز شدند. بعد از ايجاد اشتراك ميان هدفهاي miRNAها و ژنهاي با تغيير بيان، 219 ژن مشترك بهدست آمد. نتايج آناليز KEGG و GO نشان داد كه ژنها در مسيرهاي پرولاكتين، اكسيتوسين، توليد اينترلوكين 6 و تمايز لوكوسيتي نقش دارند. همچنين در شبكه miRNA-mRNA ترسيم شده، miR-548ap-5p و miR-320b با بيشترين امتياز مشخص شدند. نتيجه گيري: مطالعه حاضر miRNA ها و mRNAهاي داراي تغيير بيان و همچنين ژنهاي كليدي در سلول هاي پرز جفتي با RSA را شناسايي كرد. اين مطالعه ميتواند ماركرهاي زيستي جديدي را براي تشخيص يا درمان احتمالي RSA پيشنهاد كند.
عنوان نشريه :
زنان و مامايي و نازايي ايران
عنوان نشريه :
زنان و مامايي و نازايي ايران