مطالعه تنوع ژنتيكي بز سرخ جبالبارز با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره

مطالعه تنوع ژنتيكي بز سرخ جبالبارز با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره

به منظور بررسي تنوع ژنتيكي جمعيت بز سرخ جبالبارز با استفاده از 8 نشانگر ريزماهواره، شامل BM1312، MAF64، ILSTS034، ILSTS059، OraFCB20، IL2RA، LSCV24 و LSCV11 مطالعه شد. نمونه خون از 100 راس بز سرخ جبالبارز از ده گله به صورت تصادفي گرفته شد و تخليص DNA با استفاده از كيت DIATOM DNA PREP انجام گرفت. واكنش زنجيره‌اي پليمراز براي اين جايگاه‌ها انجام گرفت و تمامي هشت جايگاه مورد مطالعه از چند شكلي مناسبي برخوردار بوده و ميانگين تعداد آلل مشاهده شده براي آن ها 62/7 به دست آمد. در پنج جايگاه ILSTS034، ILSTS059، OraFCB20، IL2RA و LSCV11 انحراف معني‌داري را از تعادل هاردي- واينبرگ مشاهده شد (05/0P < ). دامنه هتروزايگوتي در اين جمعيت از 7616/0 براي جايگاه IL2RA تا 8743/0 براي جايگاه OraFCB20 متفاوت بود. شاخص شانون و محتوي چند شكلي (PIC) نيز نشان داد كه جايگاه IL2RA داراي كمترين تنوع و جايگاه ORAFCB20 داراي بيشترين تنوع مي‌باشند. همچنين تعداد آلل‌هاي مشاهده شده، تعداد آلل موثر و هتروزايگوتي مورد انتظار براي هر جايگاه محاسبه گرديد. ميانگين هتروزايگوتي براي اين جمعيت 8116/0 برآورد گرديد. در مجموع مي‌توان نتيجه گرفت كه جمعيت بز سرخ جبالبارز از تنوع ژنتيكي نسبتاً بالايي برخوردار است، بنابراين، مي‌توان در برنامه‌هاي حفاظت و اصلاح نژادي در اين جمعيت از اين پتانسيل به خوبي بهره‌برداري نمود.

Genetic diversity of Red Jabal Barez red goat population was studied based on eight microsatellite markers consist BM1312, MAF64, ILSTS034, ILSTS059, OraFCB20, IL2RA, LSCV24 and LSCV11. Blood sample extracted of 100 Red Jabal Barez goats were randomly collected from 10 farms and DNA was isolated using the Diatom DNA PREP kit. The PCR reactions were successfully done and all loci showed suitable polymorphism with 7.62 alleles, on average. Five loci of LSCV11, ILSTS034, ILSTS059, OraFCB20, IL2RA were at Hardy-Weinberg disequilibrium (P < 0.05). In this population, hetrozygosity varied from 0.7616 at IL2RA to 0.8743 at OraFCB20 locus and the same loci had the lowest and the highest diversity based on Shannon index and polymorphic information content (PIC), respectively. Number of observed and effective alleles and expected hetrozygosity were also calculated for each locus. Average hetrozygosity was estimated as 0.81 for this population. It can be concluded that Red Jabalbarez goat benefits from approximately high genetic variation. Therefore we can well use this potential in conservative and breeding programs for this population.