تعيين توالي و بررسي مقايسه ايي- بيوانفورماتيكي ژن كد كننده پپتيد شبه كلروتوكسين از عقرب زرد ايراني (Mesobuthus eupeus)

Sequencing and comparative-bioinformatic analysis of chlorotoxin-like peptide from Iranian scorpion Mesobuthus eupeus

زمينه و هدف: در سال هاي اخير نوروتوكسين هاي عقرب از لحاظ خواص دارويي و اثرات فيزيولوژيك مورد مطالعات زيادي قرار گرفته اند. يكي از اين توكسين ها كه توجه زيادي را به خود جلب كرده است، كلروتوكسين مي باشد كه هم اكنون در درمان سرطان هاي مغز مورد استفاده قرار مي گيرد. اين مطالعه با هدف تعيين توالي و بررسي مقايسه يي بيوانفورماتيكي cDNA كد كننده پپتيد شبه كلروتوكسين از عقرب زرد ايراني انجام شد. روش بررسي: در اين مطالعه توصيفي آزمايشگاهي نمونه هاي عقرب زرد ايراني (Mesobuthus eupeus) جمـــع آوري و پس از جدا سازي غدد سم ساز، RNA كامل آن استخراج شد. با استفاده از Reverse transctiption polymerase chain reation ((RT-PCR توالي هاي Complementary DNA (cDNA) ساخته شد و سپس با پرايمرهاي اختصاصي نواحي محافظت شده سموم شبه كلروتوكسين، توالي كد كننده يك پپتيد سمي مشابه كلروتوكسين از Mesobuthus eupeus جداسازي و شناسايي شد و (MeICT) Mesobuthus eupeus Iranian Chlorotoxin نام گرفت. جهت بررسي هاي قرابتي با كمك سرور CustalW، توالي به دست آمده با توالي سموم مشابه در گونه هاي ديگر عقرب مقايسه شد. يافته ها: توالي 102 نوكليوتيدي MeICT تشابه 88% با كلروتوكسين به دست آمـده از Leiurus quinguestriatus نشان داد. MeICT اولين گزارش از توالي كد كننده اين سم از اين گونه عقرب در ايران و جهان مي باشد. نتيجه گيري: بررسي هاي همولوژي بين توالي DNA سموم شبه كلروتوكسين از عقرب هاي مختلف، تفاوت هاي متعددي نشان داد كه مي تواند خاص گونه ايراني اين عقرب باشد. همچنين تشابه زياد با كلروتوكسين احتمال استفاده درماني از MeICT را به عنوان داروي ضد سرطان گليوما مطرح مي كند.

Background and aims: Scorpion neurotoxins have been widely studied in recent years, including investigations into their physiological functions and pharmaceutical properties. Chlorotoxin is one of the most attended toxins that are used in brain cancer therapy at now. The aim of this study was to evaluate the sequencing and comparative –bioinformatic analysis of DNA coding chlorotoxin like peptide from Iranian scorpion mesobuthus eupeus. Methods: In this descriptive study Iranian scorpion Mesobuthus eupeus samples were isolated and the total RNA was extracted form venom glands. cDNA was synthesized by RT-PCR and then the sequence encoding a venom peptide with homology to chlorotoxin (named MeICT for Mesobuthus eupeus Iranian Chlorotoxin) was isolated and identified with specific primers for conserved sequences of chlorotoxin like toxins. Results: The sequence of MeICT was 102 nucleotides long and it was similar (88% identities) to that of chlorotoxin isolated from Leiurus quinguestriatus. The sequence identified in this study was compared with other similar venom sequences from other species of scorpion by CustalW server. Conclusion: Homologies analysis showed multiple differences in sequences that can be specific for Iranian subspecies of this scorpion. Furthermore, because of much similarity with chlorotoxin, MeICT may be used as therapeutic agent in glioma cancer.