ارتباط چندشكلي تك نوكليوتيدي C > T از ژن OPN با تركيب و توليد شير در گاوهاي هلشتاين ايران

An Association between the C > T Single Nucleotide Polymorphism of Bovine OPN Gene and Milk Production and Composition in Iran Holstein Cattle

چندين كاوش كل ژنومي، جايگاه هاي صفات كمي (QTL) موثر بر صفات توليدي شير را روي كروموزوم 6 گاو در نزديك موقعيت ژن OPN شناسايي كرده اند. OPN نوعي فسفوپروتيين است كه در بافت ها و سلول هاي مختلف سنتز شده و در مايعات بدن ترشح مي‌شود. در اين تحقيق، استخراج DNA از نمونه هاي خون جمع آوري شده از 398 راس گاو هلشتاين از استان هاي تهران و اصفهان انجام شد. براي استخراج DNA از روش نمكي استفاده گرديد. سپس چندشكلي تك نوكليوتيدي C > T (SNP C > T) در موقعيت 8514 از ژن OPN به روش PCR-RFLP تعيين ژنوتيپ شد. فراواني ژنوتيپ‌هاي CC، CT و TT به ترتيب 19، 57 و 24 درصد محاسبه شد. با استفاده از آزمون مربع‏ كاي، حالت تعادل براي جمعيت بررسي شد. ژنوتيپ‌هاي اين جايگاه، از تعادل هاردي-واينبرگ انحراف نشان دادند. در اين مطالعه، ارتباط معني‌داري بين ژنوتيپ‌هاي چندشكلي تك نوكليوتيدي C > T از ژن OPN با دو صفت درصد چربي تصحيح شده بر اساس دو بار دوشش در روز و درصد پروتيين شير تصحيح شده بر اساس 305 روز مشاهده شد. ارتباط معني‌دار بين چندشكلي هاي تك نوكليوتيدي با صفات شير، فرصت مناسبي براي استفاده از برنامه هاي انتخاب به كمك ماركر در گاو شيري فراهم مي آورد.

Quantitative trait loci (QTL) affecting milk production traits on bovine chromosome 6 close to the OPN gene location have been identified through several whole genome scans. OPN is a phosphoprotein, synthesized in a variety of tissues and cells and secreted into body fluids. In this study, DNA was isolated from blood samples collected from 398 Holstein cows in Tehran and Esfahan provinces. DNA isolation was performed using salting out method. RFLP-PCR method was used for genotyping of SNP C > T at position 8514 in OPN gene. Frequencies of CC, CT and TT genotypes were estimated as 19, 57 and 24%, respectively. Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) was evaluated using ? square test. The genotypes in this locus deviated from HWE. In this study, significant associations were observed between c.8514C > T genotypes in OPN gene and FATP2X, PROPER305 traits. The SNP, showing signi?cant association with milk traits would provide an excellent opportunity for marker assisted selection programs in dairy cattle.