ويروس نوارك ايراني گندم: تعيين ترادف بخشي از آر اِن اِيِ شماره 1، رابطه سرولوژيكي با ساير تنويي ويروس‌ها و شواهد آلودگي طبيعي در برنج

IRANIAN WHEAT STRIPE VIRUS: PARTIAL SEQUENCE OF RNA 1, SEROLOGICAL RELATION TO OTHER TENUIVIRUSES, AND EVIDENCE OF NATURAL OCCURRENCE IN RICE

ويروس نوارك ايراني گندم (Iranian wheat stripe virus, IWSV) يكي از اعضاي غير قطعي جنس تنويي ويروس است. در اين تحقيق چند ويژگي IWSV مورد مطالعه قرار گرفته است. به منظور روشن ساختن قطبيت قطعه اول ژنوم (RNA 1) و مقايسه انتهاي ´3 آن با ساير تنويي ويروس‌ها، در حدود 650 نوكليوتيد از انتهاي ´3 اين قطعه تكثير، همسانه سازي و سپس تعيين ترادف شد. مطالعه ترادف به دست آمده نشان داد كه قطعه فوق مشابه با اكثر تنويي ويروس‌ها، داراي قطبيت منفي بوده و از نظر ترادف نوكليوتيدي و آمينو اسيدي ژن آر اِن اِ پليمراز، بيشترين شباهت را با تنويي ويروس‌هاي عامل برگ سفيد برنج در قاره امريكا دارد. تا قبل از اين مطالعه، گندم تنها ميزبان طبيعي و شناخته شده IWSV بود. در اين بررسي، برنج به عنوان يكي از ميزبانان اقتصادي ويروس از منطق برنجكاري شمال شيراز شناسايي شد. به منظور مقايسه جدايه‌هاي گندم و برنج، ژن‌هاي پروتيين پوششي (CP) و پروتيين عمده غير ساختماني (NS4) جدايه برنج با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي تكثير و بعد از همسانه سازي، با قسمت‌هاي مشابه در جدايه گندم مقايسه شدند. نتايج نشان داد كه ژن‌هاي فوق در دو جدايه، از نظر ترادف نوكليوتيدي و ترادف آمينو اسيدي به ترتيب 6/99 و 100-0/99 درصد به هم شباهت دارند. مطالعات سرولوژيكي براي روشن ساختن ارتباط IWSV با پنج تنويي ويروس ديگر با استفاده از آزمون‌هاي نشت دو طرفه در آگار، ديبا و/يا الايزاي غير مستقيم با كمك آنتي‌سرم‌هاي توليد شده بر عليه CP يا NS4 نشان داد كه IWSV از ميان ساير تنويي ويروس‌هاي مورد مطالعه، تنها با ويروس برگ سفيد برنج (Rice hoja blanca virus, RHBV) ارتباط سرولوژيكي دارد. اين نتيجه همراه با نتايج حاصل از مقايسه‌هاي مربوط به ترادف نوكليوتيدي و آمينو اسيدي، يك بار ديگر شباهت IWSV را با تنويي ويروس‌هاي عامل برگ سفيد در قاره امريكا تاييد مي‌كند. مايه‌زني گندم با تزريق عصاره گياه آلوده به بذرهايي كه 30 دقيقه در آب C?25 خيس خورده بودند، موفقيت‌آميز بود و ويروس با راندمان 2/5 در صد به گياهچه‌هاي حاصل از اين بذرها منتقل شد.

Iranian wheat stripe virus (IWSV) is a tentative member of the genus Tenuivirus. In this study, several properties of the virus were studied. To determine the polarity of the IWSV RNA 1 segment and compare it to corresponding segment of other tenuiviruses, about 650 bp fragments of the 3´ end of this segment was amplified, cloned and sequenced. Sequence comparison showed that similar to other tenuiviruses, the IWSV RNA 1 is of negative polarity and more similar to tenuiviruses causing white leaf in American continent. Previously, only wheat had been reported as the natural host of IWSV. In this study, we identified rice as an economical natural host of the virus in rice growing areas in north of Shiraz. The coat protein (CP) and non-structural protein (NS4) genes of IWSV rice isolate were amplified, sequenced and compared with the corresponding genes of the wheat isolate. The nucleotide and amino acid sequence identities of the CP and NS4 genes between two isolates were 99.6 and 99-100%, respectively. The serological relationships between IWSV and five tenuiviruses were determined by agar gel diffusion (AGD), dot-immunobonding assay (DIBA) and/or indirect enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) using antisera against CP or NS4 proteins. These results showed that among five tenuiviruses, IWSV is related only to Rice hoja blanca virus (RHBV). Serological and molecular studies again confirmed similarities between IWSV and tenuiviruses causing white leaf in American continent. IWSV was successfully transmitted by embryo injection of wheat seeds presoaked in water for 30 mins at 25°C with an efficiency of 5.2%.