بررسي ارتباط پلي مورفيسم SNP-43 از ژن Calpain-10 با ديابت شيرين نوع دو در جمعيت آذربايجان شرقي

A study on association of SNP-43 polymorphism in Calpain-10 gene with type 2 diabetes mellitus in the population of Eastern Azerbaijan province

زمينه: جستجوي گسترده ژنوم جهت يافتن استعداد ژنتيكي ابتلا به ديابت نوع 2 در جمعيت هاي مختلف، تاكنون نتايج متفاوتي را در برداشته است. اخيراٌ Calpain10 به عنوان يك ژن مستعدكننده ابتلا به ديابت نوع 2 در ناحيه NIDDM1 شناخته شده است. هدف از اين مطالعه تعيين ارتباط پلي مورفيسم اينترون3 (SNP-43) از ژن calpain10 با بيماري ديابت نوع 2 مي باشد. مواد و روش‌ها: در اين مطالعه مورد- شاهدي 102 فرد ديابتي و 100 فرد سالم در استان آذربايجان شرقي بررسي گرديد. ژنوتيپ هاي مختلف اين پلي مورفيسم از ژنcalpain10 با استفاده ازروش PCR-RFLP تعيين شد و از آزمون مجذور كاي و رگرسيون لجستيك براي تحليل داده ها استفاده گرديد. يافته‌ها: توزيع ژنوتيپي پلي مورفيسم ژن calpain10 در گروه كنترل براي ژنوتيپ هايA/G ، G/G، A/A به ترتيب 11 (11 درصد)، 86 (86 درصد) و 3 (3 درصد) بود. توزيع ژنوتيپ ها در گروه بيمار7 (9/6 درصد)، 95 (1/93 درصد) و صفر بود. فراواني آلل G در بين افراد بيمار نسبت به افراد سالم اختلاف معناداري را نشان مي داد (037/0P=). نتيجه گيري: از آنجا كه داشتن آلل G ريسك فاكتور ابتلا به ديابت نوع دو در نظر گرفته شده است، لذا مي توان گفت كه پلي مورفيسم 43 از ژنcalpain10 در جمعيت آذربايجان شرقي ارتباط معناداري با بيماري ديابت نوع دو دارد.

Background: Genome – wide analysis of genetic predisposition to type 2 diabetes mellitus in different populations have yielded variable results. Calpain10, a gene that encodes a non-lysosomal cysteine protease, has been recently proposed as a type 2 diabetes susceptibility genes in the non-insulin-dependent diabetes mellitus NIDDM1 region. Aim of the study is to evaluate the relation between SNP43 and type2 diabetes. Methods: A total of 102 diabetic subjects and 100 undiabetic controls enrolled in a case-control study in Eastern Azerbaijan Azerbaijan Province. The polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism technique (PCR–RFLP) was applied. We use X2 test and logistic regression to analysis of data. Results: Genotypes distribution of calpain10 gene in control group were 11(11%), 86(86%) and 3(3%) with respected to A/G, G/G and A/A genotypes, respectively. In diabetic group genotypes distribution were 7(6.9%), 95(93.1%) and zero, respectively. The G allele frequency was significant difference in case and control groups. Conclusion: Since G allele is a risk factor to affect type 2 diabetes disease; hence SNP43 of calpain10 gene had significant association with type 2 diabetes in Eastern Azerbaijan.