بررسي تنوع ژنتيكي نمونه‌هاي Aegilops tauschii نواحي شمالي ايران با استفاده از نشانگرهاي SSR

Evaluation of Genetic Diversity of Aegilops Tauschii from Northern Area of Iran Using SSR Markers

به منظور بررسي تنوع ژنتيكي 86 نمونه Aegilops tauschii جمع‌آوري شده از نواحي شمالي ايران از 10 جفت تواليهاي تكراري ريزماهواره استفاده شد كه 9 جفت از آنها چند شكلي مناسبي نشان دادند. در مجموع 140 آلل براي تمام لوكوسها مشخص شد كه داراي دامنه بين 9 تا 25 آلل و ميانگين 5/15 آلل براي هر لوكوس بودند. محتواي اطلاعات چند شكلي (PIC) از 16/0 براي لوكوس WMS111 تا 38/0 براي لوكوس WMS114 متفاوت بود. ميانگين شباهت ژنتيكي مشاهده شده 101/0 و بيشترين ميزان شباهت ژنتيكي (88/0) بين دو نمونه از استانهاي گيلان و قزوين و كمترين ميزان(0) هم بين تعدادي از نمونه‌‌ها مشاهده شد. روشهاي گروه بندي خوشه اي و تجزيه به مختصات اصلي نتوانست نمونه‌ها را به طور كامل از هم تفكيك كند كه نشان‌دهنده وجود تنوع ژنتيكي بالا در بين نمونه‌ها مي باشد.

In this study, in order to study genetic diversity in the accessions of Aegilops tauschii from Northern area of Iran, 86 accessions of this species selected and evaluated using SSR markers. Ten SSR primer pairs were applied for genotyping assays. A total of 140 alleles were detected across all loci, ranging from 9 to 25 alleles per locus, with an average of 15.5 alleles per locus. The polymorphic information content (PIC) values of the loci ranged from 0.16 (WMS111) to 0.38 (WMS114). Genetic similarity calculated from the SSR data ranging from 0 (many genotypes) to 0.88 (two genotypes from Ghazvin and Gilan) with an average of 0.101. Cluster and PCA analyses could not separate accessions, indicating that there is high genetic diversity among accessions.