مقايسه ژنتيكي جمعيت‌‌هاي ماهي سوكلاي (Rachycentron canadum) خليج فارس و درياي عمان با استفاده از روش ميكروستلايت

Genetic comparison of Persian Gulf and Oman Sea populations of the Cobia, Rachycentron canadum by means of microsatellite technique

در اين مطالعه تنوع ژنتيكي جمعيت‌هاي ماهي سوكلا با استفاده از روش ميكروستلايت در سواحل شمالي خليج فارس و درياي عمان شامل مناطق بوشهر, بندر دير, بندر لنگه, بندر عباس, پزم و بريس چابهار مورد بررسي قرار گرفت. محصولات تكثير شده با استفاده از 10 جفت پرايمر ميكروستلايت، بر روي ژل پلي‌آكريل آميد 8 درصد الكتروفورز و با نيترات نقره رنگ‌آميزي شدند. نمايش خوشه اي فاصله ژنتيكي به روش جفت گروهي غير وزني از طريق ميانگين حسابي با استفاده از نرم‌افزار TFPGA version 1.3 ترسيم گرديد. نتايج نشان داد كه ميانگين تعداد آللي مشاهده شده و موثر به‌ترتيب 357/12 و 319/8، همچنين ميانگين هتروزيگوسيتي مشاهده شده و مورد انتظار به‌ترتيب 655/0 و 874/0 تعيين شد. بر اساس تست AMOVA حداكثر Fst (063/0) بين نمونه‌هاي بندر دير با نمونه‌هاي پزم كه داراي كمترين ميزان جريان ژني (7/3) است مشاهده شد. بيشترين فاصله ژنتيكي (815/0) در نمونه‌هاي متعلق به مناطق دير و بريس مشاهده شد. بر اساس نتايج موجود مشخص شد كه ماهي سوكلا در مناطق مختلف نمونه‌‏برداري در خليج فارس و درياي عمان حداقل داراي 3 جمعيت مجزاست (1- جمعيت ناحيه بوشهر 2- جمعيت ناحيه هرمزگان 3- جمعيت ناحيه چابهار) و ماركرهاي اختصاصي جمعيت بوشهر با استفاده از پرايمرهاي Rca 1B-E08A, Rca 1B-F07, Rca 1B-H09 و Rca 1-A04 شناسايي شد بطوري‌كه با حضور آلل‌هاي اختصاصي با وزن مولكولي مشخص شناسايي جمعيت ماهي سوكلاي منطقه بوشهر از ساير مناطق امكان‌پذير است.

In this study genetic diversity of Cobia, Rachycentron canadum populations were assessed using microsatellite technique in the northern coasts of Persian Gulf (Booshehr, Dayer Port, Lengeh Port & Bandarabass) and Oman Sea (Pozm & Beris of Chabahar). Polymerase chain reactions (PCR) were conducted on the target DNA using 10 paired microsatellite primers. PCR products were electrophoresed on polyacrylamid gels (8%) that were stained using silver nitrate. Diagram of genetic distance was calculated using the UPGMA method in TFPGA version 1.3 for any level of the hierarchy. The results showed that the mean of observed and effective allele number was 12.357 and 8.319 respectively. Mean observed and expected heterozygosity was 0.655 and 0.874 respectively. Based on Analysis of Molecular Variance (AMOVA) the highest Fst (0.063) was observed when comparing specimens from Dayer Port zone and Pozm of Chabahar zone (Nm=3.7). The highest genetic distance (0.815) was observed between specimens from Dayer Port zone and Beris of Chabahar zone. The result obtained from the present study shows that at least 3 different population of R. canadum are found in the northern coasts of Persian Gulf and Oman Sea, which are including: Booshehr region population, Bandarabass region population, and Chabahar region population. Specific markers were also identified for of the Booshehr zone population identified. The Booshehr population zone can be identified using primers Rca 1B-E08A, Rca 1B-F07, Rca 1B-H09 and Rca 1-A04.