مطالعه تنوع ژنتيكي پسته ايراني با استفاده از چند نشانگر بين ريزماهواره اي ISSR

Study of Genetic Diversity in Iranian Pistachio Cultivars with Inter- microsatellite ISSR Markers

پسته (Pistacia vera L.) يكي از مهمترين محصولات باغي ايران است كه سهم زيادي از درآمدهاي صادراتي غيرنفتي كشور را به خود اختصاص داده است. بهترين راهكار براي رسيدن به بالاترين ميزان عملكرد، احداث باغهاي هموژن و اصيل ژنتيكي است كه در اين خصوص بررسي دقيق تنوع ژنتيكي امكان احداث باغهاي يكنواخت با ژنوتيپ هاي برتر را ميسر مي سازد. در اين مطالعه تنوع ژنتيكي 19 توده پسته ايراني با استفاده از 20 آغازگر ISSR مورد ارزيابي قرار گرفت كه از اين تعداد 10 آغازگر باندهاي تكرار پذير مناسب توليد كردند. در اين بررسي در مجموع 114 قطعه DNA (مكان ژني) تكثير و امتياز بندي شدند كه از آنها 73 قطعه (64 درصد) چند شكلي نشان دادند. ميانگين محتواي چند شكلي اطلاعات (PIC) براي آغازگرهاي استفاده شده از حداقل 85 درصد تا حداكثر 91 درصد متغير بود. براي ارزيابي شباهت‌ها و اختلافات ژنومي بين ارقام از ضريب تشابه جاكارد استفاده شد. كمترين فاصله بين ارقام كله قوچي و احمد آقايي با ميزان تشابه 83/0 و بيشترين فاصله ژنتيكي بين ارقام كله قوچي، حسين خاني و ابراهيم آبادي با ميزان تشابه 54/0 مشاهده شد. با توجه به ضريب همبستگي كوفنتيك بين ماتريسهاي تشابه و ماتريس خروجي دندروگرام، كلاستر بندي حاصل از روش UPGMA مناسب ترين گروه بندي را حاصل نمود كه بر اين اساس و با استفاده از نمودار درختي حاصل ارقام در سه گروه اصلي 2، 4 و 13 رقمي گروه بندي شدند. در اين تحقيق نشانگر ISSR براي مطالعات بررسي تنوع ژنتيكي و تهيه شناسنامه مولكولي كامل براي تمام توده‌هاي پسته ايراني مناسب تشخيص داده شد.

Pistachio is one of the most important horticultural crops of Iran. The best way to have high yields is genetically pure and monogenous gardens. Thereby, study of genetic diversity makes this possible to have homogenous gardens with high performance genotypes. In the present study, the genetic diversity among nineteen cultivars was assessed using inter-simple sequence repeats (ISSR) primers. The survey was done by 20 ISSR primers, out of them 10 with polymorphic bands was selected for genotyping. With 10 ISSR primers, 114 DNA fragments (loci) were produced that 73 of them (64.03%) were polymorphic. The mean of polymorphism information content (PIC) for the primers was ranged from 85% to 91%. The genetic similarity matrix was constructed using Jaccard coefficient. The genetic distance was ranged from 0.53 (low similarity) between kale- ghochi, hosein-khani and ebrahim-abadi up to 0.83 (high similarity) between kale-ghochi and ahmad-aghai. Based on cophenetic correlation coefficients, the best Clustering dendrogram was constructed by unweighted pair group method using arithmetic average (UPGMA). Cluster analysis revealed three main groups with 2, 4 and 13 pistachio varieties in each group. The present study showed that the use of ISSR markers for investigation on genetic diversity and providing genetic identifications of different Iranian pistachio cultivars could be useful and informatics.