بررسي تمايز ژنتيكي سه جمعيت سگ‌هاي گله سرابي، سنگسري و افشاري با استفاده از تعيين تواليDNA كروموزوم جنسي Y

Genetic differentiation among three populations of Sarabi, Sangsari and Afshari guardian dogs using DNA sequencing of sexual Y chromosome

در ايران انواع مختلفي از نژادهاي سگ مشاهده مي‌شود كه برخي از آنها از نظر فنوتيپي كاملاً با يكديگر متفاوت و برخي ديگر تا حدودي با يكديگر شباهت دارند و از آنها بصورت تجربي در گله‌هاي عشايري استفاده مي‌شود. براي شناسايي و تعيين ميزان تنوع ژنتيكي موجود در قسمتي از ژنوم كروموزوم جنسي Y در بين جمعيت سگ‌هاي سرابي، سنگسري و افشاري، از 21 قلاده سگ نر غيرهم‌خون از اين سه جمعيت، نمونه خون گرفته شد. نمونه‌هاي خون در لوله‌هاي آزمايش EDTA دار طي زنجيره سرد به آزمايشگاه منتقل شدند. استخراج DNA توسط كيت استخراج انجام شد، آغازگرهاي رفت و برگشت طراحي شدند و سپس توالي‌هاي بدست آمده با استفاده از نرم‌افزارهاي MEGA4 و FinchTV_1_4_0 آناليز شدند. پس از تعيين توالي‌هاي تكثير شده، نتايج گوياي اين واقعيت بودند كه كليه توالي‌ها حفاظت شده مي‌باشند. وجود توالي‌هاي تكراري باعث بوجود آمدن صفحات لرزان شده بود كه قابل توجه است. در اين پژوهش از 2 روش پيوند همجواري و روش جفت گروهي غيروزني از طريق ميانگين حسابي براي ترسيم درخت فيلوژنتيك استفاده شد. نتيجه درخت ترسيم شده در اين روش حاكي از عدم وجود شباهت بين توده‌هاي بررسي شده مي‌باشد. در مجموع مي‌توان نتيجه گرفت سه جمعيت سگ‌هاي گله سرابي، سنگسري و افشاري ايران از نظر ژنتيكي متمايز مي‌باشند.

Several breeds of dogs can be found in Iran. Some of them are completely different in their phenotype while others are similar. These animals are kept in rural families as guard animals for their herds. In order to study the genetic diversity of a part of Y sex chromosome between and within the population of Sarabi, Sangsari and Afshari dogs, total number of 21 non inbred male dogs were sampled. Blood samples collected from these animals were transferred to laboratory by EDTA containers. DNA extraction was applied using extraction kits and forward and reverse primers were designed using Oligo5 software. After sequencing, results were analyzed by Finch and Mega4 softwares. Analyzing the replicated sequences showed that all of the sequences were conserved and having repeated sequences caused the existence of slip pages. In this study, both neighbor joint approach and unweighted pair-group method of the arithmetic average (UPGMA) were utilized to draw phylogenetic tree. Results showed that these three populations of dogs, based on their genetic, are completely different.