بررسي شيوع گاستروانتريت و شناسايي ژنوتايپ هاي در حال گردش روتاويروسي در كودكان بستري شده در برازجان سال هاي 1388-1387

Prevalence of rotavirus gastroenteritis and circulating genotypes in children hospitalized in Borazjan, during 2008-2009

زمينه: روتاويروس هاي انساني، از مهم ترين عوامل ايجادكننده گاستروانتريت حاد ويروسي در نوزادان و كودكان كم سن و سال جهان محسوب مي شوند. با تاييد واكسن هاي جديد روتاويروسي، اطلاعات مربوط به شيوع بيماري و تنوع ژنوتايپ هاي روتاويروس در حال گردش مي تواند در راهبردهاي ايمن سازي مورد توجه قرار گيرد. هدف از اين مطالعه، شناسايي ژنوتايپ هاي پروتيين VP7 روتاويروس در كودكان بستري شده در شهر برازجان مي باشد. مواد و روش‌ها: در اين پژوهش 375 نمونه مدفوعي از كودكان زير 7 سال مبتلا به اسهال شديد بستري شده در بيمارستان 17 شهريور برازجان در طول سال هاي 1388-1387 جمع آوري شد. براي شناسايي آنتي ژن گروه A روتاويروس از روش الايزا استفاده گرديد. سپس ژنوتايپ نمونه هاي مثبت با روش Nested RT-PCR مورد ارزيابي قرار گرفت. يافته‌ها: از مجموع نمونه هاي جمع آوري شده، عفونت روتاويروسي در 27/24 درصد موارد شناسايي گرديد. بالاترين ميزان عفونت در كودكان 12 تا 17 ماه (93/6 درصد) مشاهده شد (056/0=P). همچنين بيشترين شيوع عفونت مربوط به فصل پاييز با فراواني 94/54 درصد و كمترين شيوع مربوط به فصل تابستان با فراواني20/2 درصد بود (001/0P=). فراواني ژنوتايپ هاي G1، G4، G9 و غيرقابل تايپ به ترتيب 65/51 درصد، 20/2 درصد، 40/4 درصد و 76/41 درصد بودند. اما ژنوتايپ هاي G2، G3، G8، G10 و G12 در هيچ‎يك از نمونه هاي مورد بررسي شناسايي نشد. نتيجه گيري: فراواني قابل توجه ژنوتايپ هاي غيرقابل تايپ، ضرورت استفاده از ساير پرايمرها و نيز تعيين ژنوتايپ هاي غيرمعمول به كمك ساير پرايمرهاي اختصاصي را نشان مي دهد. همچنين به دليل شيوع بالاي عفونت روتاويروسي ضرورت پايش مداوم بيمارستاني و ايمن سازي گسترده به ويژه در كودكان زير 2 سال وجود دارد.

Background: Human rotaviruses are the major etiological agents of acute viral gastroenteritis in infants and young children worldwide. With the licensure of new rotavirus vaccines, data on the burden of disease and the diversity of rotavirus genotypes circulating are important regarding immunization strategies. The purpose of the present study was to determine the genotypes of VP7 protein rotavirus in hospitalized children in Borazjan. Methods: In this study,375 stool samples from children less than 7 year old with severe diarrhaea hospitalized at 17 Shahrivar hospital in Borazjan, were collected during 2008 to 2009. Group A rotavirus antigen was detected in stool specimens using Enzyme Immunoassay (EIA). Then G-typing of the positive specimens was evaluated by Nested RT-PCR method. Results: Among the collected samples, 24.27% were positive for rotavirus infection. The highest incidence was observed in children aged 12-17 months (6.93%) (p=0.056). The most common prevalence of positive rotavirus was observed in autumn with 54.94% compared to the least prevalence in summer with 2.20% (p=0).The frequency of G1, G4, G9 ,non-typeable genotypes were 51.65%, 2.20 %, 4.40%, 41.76% ,respectively. But, G2, G3, G8, G10 and G12 genotypes weren’t detected. Conclusion: The noticeable frequency of non-typeable genotypes indicates that must be using from another primers for characterization of unusual genotypes. Also because of the high frequency of rotavirus infection, surveillance and expanded program of immunization especially for children less than 2 years is necessary.