تفكيك گونه هاي مهاجم علف هرز آبزي مريافيلوم (Myriophyllum spp.) از خويشاوندان بومي آن با استفاده از باركدگذاري DNA

Discrimination of the Invasive Plant Species, Myriophyllum spp., From Native Relatives Using DNA Barcoding

در مطالعه حاضر 81 نمونه متعلق به 13 گونه مختلف از جنس مريافيلوم مورد بررسي قرار گرفت كه از مناطق بين ژني هسته اي ITS1 و ITS2، مناطق كلروپلاستي matK، rbcL و trnH-psbA براي تشخيص گونه هاي بومي و مهاجم متعلق به اين جنس استفاده گرديد. نتايج نشان داد كه توالي ITS1 و ITS2با اينكه حاوي جايگاه هاي متغير متعددي بودند كه باعث تفكيك گونه ها از همديگر شدند ولي به دليل درصد تكثير پايين آنان در ميان نمونه هاي مورد بررسي به‌عنوان باركد مناسب انتخاب نشدند. اگرچه matK درصد تكثيري بالايي داشت ولي به دليل وجود ساختار ثانويه در توالي اين ژن و همچنين طول بلند آن توالي يابي مناسب آن ممكن نگرديد. بر اساس نتايج به‌دست آمده در اين مطالعه منطقه غير كدكننده trnH-psbA و قسمتي از منطقه كدكننده ژن rbcL بخاطر دارا بودن درجه عموميت بالاي تكثير و نيز قدرت بالاي تفكيك در بين گونه هاي مورد بررسي مريافيلوم، به‌عنوان باركد ايده آل براي تشخيص گونه هاي مريافيلوم معرفي شدند. بنظر مي رسد كه سرمايه گذاري روي تكنيك باركدگذاري DNA مي تواند ابزار قوي براي تشخيص و تفكيك نمونه هاي گياهي را در اختيار پژوهشگران قرار دهد. بويژه زمانيكه از لحاظ مورفولوژيكي تشخيص گونه ها از يكديگر مشكل باشد مي توان از باركدگذاري DNA بهره جست.

This study included 81 samples which belonged to 13 speices from Myriophyllum genus. Both nrDNA ITS1 and ITS2 and cpDNA matK, rbcL and trnH-psbA loci were used for diagnose of invasive from native plant. The nrDNA ITS1and ITS2 data proved highly variable and could differentiate between all but had low PCR amplification success,based on these result they would not recommend as a suitable barcode in Myriophyllum genus. Although matK had high amplification success but had low sequencing success which could not be ideal barcode among studied species. Based on result Non-coding trnH-psbA spacer region and a portion of the coding rbcL gene are recommended as ideal barcode that provide the necessary universality and species discrimination among Myriophyllum species. a limited investment in DNA barcoding can generate an identification tool for plant material, specifically useful for cases where morphology is inadequate to assess species identity.