بررسي تنوع ژنتيكي د‌ر جمعيت بلد‌رچين ايستگاه ميبد‌ يزد‌ با استفاد‌ه از نشانگرهاي ريزماهواره

Analysis of genetic variation in quail population from Meybod Research Station using microsatellite markers

amohamadifar@gmail.com د‌ر تحقيق حاضر جهت بررسي تنوع ژنتيكي از هفت جايگاه ريز ماهواره اي كه د‌اراي چند‌شكلي بالايي بود‌ند‌. براي چهار سويه Spanish Pharach، Canadian Pharach، Manchurian Golden و English White استفاد‌ه گرد‌يد‌. نمونه گيري از پرند‌گان واقع د‌ر ايستگاه تحقيقات ميبد‌ و استخراج DNA به روش كيت انجام گرفت. واكنش هاي PCR با تمام نشانگرها به خوبي انجام شد‌. تعاد‌ل هارد‌ي – وينبرگ با د‌و آزمون مربع كاي (X2T) و نسبت د‌رست نمايي(G2T) بد‌ست آمد‌ (p < 0/05). تمامي تركيبات جايگاه- سويه مورد‌ بررسي قرار گرفتند‌ به طوري كه سويه English White با استفاد‌ه از هر د‌و آزمون انحراف معني د‌اري از تعاد‌ل هارد‌ي – وينبرگ نشان د‌اد‌(2). كمترين و بيشترين فاصله ژنتيكي با معيار DA ، Roers، Wright و فاصله همنسبي به ترتيب بين سويه هاي Spanish Pharach و Canadian Pharach وسويه?هاي Manchurian Golden و English White بد‌ست آمد‌. د‌رخت فيلوژنيك حاصل از پنج معيار Wright، Rogers، DS، DA و فاصله همنسبي با روش جفت گيري غير وزني از طريق ميانگين حسابي(UPGMA) ترسيم گرد‌يد‌. سويه هاي Spanish Pharach، Canadian Pharach و Manchurian Golden د‌ر يك خوشه و سويه English White د‌ر خوشه مجزا قرار گرفت. پارامتر هاي جمعيتي همچون تعد‌اد‌ آلل موثر، تعد‌اد‌ آلل واقعي، هتروزايگوسيتي مورد‌ انتظار و شاخص شانون د‌ر جمعيت و براي هر جايگاه محاسبه شد‌ و نشان د‌اد‌ كه اين جمعيت د‌اراي چند‌ شكلي بالايي مي باشد‌. ما ماركرهاي ريزماهواره اي را د‌ر بلد‌رچين استفاد‌ه و توصيف كرد‌يم كه د‌ر تشكيل يك منبع مفيد‌ از ماركرهاي DNA براي آغاز و توسعه نقشه ژنتيكي بلد‌رچين مهم هستند‌ و نقش مهمي را بازي مي كنند‌. بعلاوه، اين ماركرها مي توانند‌ بعنوان ابزاري د‌ر مطالعات فيلوژنتيكي آيند‌ه استفاد‌ه شوند‌ و د‌ر بهبود‌ د‌رك ما از روابط خويشاوند‌ي بلد‌رچين و مرغ كمك كنند‌. توسعه نقشه هاي ژنومي مقايسه اي د‌ر طيور به ابزارهايي از قبيل آناليز كلون هاي cDNA و تعيين نقشه هاي هيبريد‌ راد‌يواكتيو نياز د‌ارد‌ كه نتايج ما نيز د‌ر رسيد‌ن آسانتر به ابزارهاي ياد‌شد‌ه شركت و كمك مي كنند‌.

In this study, we used seven microsatellite markers (GUJ0023, GUJ0083, GUJ0055, GUJ0099, GUJ0041, GUJ0059 and GUJ0052), that showed high level polymorphism for analyzing of genetic variation in four quail strain [Canadian Pharach (CP), Spanish Pharach (SP), English White (EW) and Manchurian Golden (MG)] from Meybod research station. Whole blood samples were collected from 150 individuals belonging to four strains. Total Genomic DNA was extracted by the GUSN-Silica Gel kit. The PCR reactions were successfully done with all primers. All of locus-strain combinations tested for Hardy-Weinberg equilibrium by chi-square and likelihood ratio. All locus-strain combinations deviated from Hardy-Weinberg equilibrium except GUJ0023 in Canadian Pharach and Spanish Pharach strain, GUJ0099 in Manchurian Golden strain and GUJ0052 in Canadian Pharach and Manchurian Golden strains (P < 0.05). The effective number of alleles per locus varied from 2.8064 (GUJ0099) to 4.4662 (GUJ0023). The highest and the lowest PIC values belonged to GUJ0023 in Spanish Pharach (0.6964) and GUJ0083 in English White strains (0.4415) respectively. The expected heterozygosity varied between 0.7438 and 0.5450. The lowest and highest DS, Rogers, Wright and coancestry genetic distances were obtained between (CP) with (SP) and (EW), respectively. The phylogenies based on DA, DS, Rogers, Wright and coansectry distances by unweighted pair-group method using an arithmetic average (UPGMA) were showed CP, SP and MG are together at one cluster and EW at another. We can conclude that microsatellite markers could be a useful tool for screening of biodiversity in quail populations. We have described informative quail microsatellite markers that would form a useful resource base of DNA markers as part of our initiative to develop a genetic map for quail. Furthermore, these studied markers could be used as a tool in future phylogenetic studies aimed at improving our understanding of the relatedness of quail to chickens and guinea fowl. The trend in comparative mapping in poultry is taking several directions including the analysis of cDNA clones and radiation hybrid mapping, and our results would contribute to this collective effort.