بررسي روابط ژنتيكي ژنوتيپ هاي بادام زراعي و وحشي با استفاده از نشانگر مولكولي RAPD

Genetic Relatedness among Wild and Cultivated Almond GenotypesUsing RAPD Marker

در اين بررسي تنوع ژنتيكي 36 رقم و ژنوتيپ بادام ايراني، آمريكايي و اروپايي به همراه 3 گونه وحشي بادام با استفاده از 60 آغازگر ده نوكليوتيدي مورد مطالعه قرار گرفت. 47 آغازگر كه الگوهاي باندي قوي و تكرارپذير داشتند، براي تجزيه و تحليل داده ها استفاده شدند. از مجموع 968 باند توليد شده، 918 باند (83/94 درصد)، چند شكل بودند. با توجه به دندروگرام حاصل و ماتريس تشابه به خوبي آشكار گرديد كه ميزان تشابه ژنتيكي بين ارقام و ژنوتيپ هاي تحت مطالعه، پايين و تنوع بين آنها نسبتا زياد بود. بيشترين شباهت بين دو رقم ايراني سفيد و منقا (89/0) و كمترين آن بين رقم سنگي 28 و گونه وحشي A. scoparia (29/0) مشاهده شد. به منظور ترسيم دياگرام خوشه‌اي، از روش UPGMA و ضريب تشابه جاكارد استفاده شد. در ابتدا دو گونه وحشيA. scoparia و orientalis A. ، دو ژنوتيپ سنگي28 و سنگي13 و رقم آمريكايي تامسون كه بيشترين فاصله را از گروها داشتند از ساير ارقام و ژنوتيپها جدا شده و سپس ارقام، ژنوتيپها و گونه هاي باقي مانده در فاصله ژنتيكي 50/0 به دو گروه تفكيك شدند. نتايج حاصل از اين مطالعه، گروهبندي ارقام و ژنوتيپ‌هاي مورد مطالعه را بر اساس منشا جغرافيايي يا دودمان نشان مي‌دهد و نشانگر RAPD به خوبي قادر به تفكيك ارقام، ژنوتيپ‌ها و گونه‌هاي بادام از يكديگر بوده و تكنيك مناسبي جهت مطالعه ژرم پلاسم بادام مي‌باشد.

In this experient, RAPD markers were used to evaluate the genetic relationships among 36 Iranian, European, American and Russian almond cultivars and three wild Amygdalus species. Sixty10-mer primers were used which totally created polymorphism 47 primers, which produced reproducable banding patterns, were used for further analysis. A total of 918 polymorphic RAPD bands were selected omong of 968 bands. Regarding the dendrogram and similarity matrix, it was concluded that the genetic similarity value among studied cultivrs and genotypes was low and the genetic variation among them was relatively high. Similarity index among the studied cultivars varied between 0.29 and 0.89 with mean of 0.53. The maximum and minimum similarity observed between Monagha and Sefid (0.89), and A. scoparia with Sangi28 geneotype (0.29), respectively. Cluster analysis was computed based on Jaccard similarity coefficient using UPGMA method and the resulting clusters were represented as dendrogram extracted from the showed dendrogram, 47 polymorphic primers discriminated among all the cultivars and species. The resulting dendrogram divided the cultivars and species into two clusters (at 0.50 similarity values) with American Thompson cultivar, two Sangi genotype and two Amygdalus species as the most distant from the group. Cluster analysis of similarity data grouped the cultivars according to their geographic origin and or their pedigree information. Iranian, European and American cultivars were clustered into three separate groups.