بررسي چند شكلي نشانگر‌هاي ريزماهواره‌ ايBM6444، INRA135 و oarhh35 مرتبط با ژن‌ اينهيبين در گوسفند سنجابي

Assessing Polymorphism in BM6444, INRA13 and Oarhh35 Microsatellite Markers Associated with Inhibin Gene in Sanjabi Sheep

هدف از تحقيق حاضر شناسايي ميزان پلي‌مورفيسم در نشانگر‌هاي ريزماهواره‌اي BM6444، INRA135 و oarhh35 مرتبط با ژن‌ اينهيبين در گوسفند سنجابي بود. براي اين منظور به طور تصادفي از 100 راس (78 ميش و 22 قوچ) ايستگاه تحقيقات دامپروري مهرگان كرمانشاه خونگيري به عمل آمد. با استفاده از روش نمكي بهينه يافته نمونه هاي DNA استخراج شدند. از واكنش زنجيره‌اي پلي‌مراز و جفت آغازگرهاي اختصاصي جايگاه هاي ريز ماهواره‌اي براي تكثير قطعه هاي مورد آزمايش استفاده گرديد. در اين آزمايش براي شناسايي ژنوتيپ‌هاي حاصل از روش رنگ آميزي نيترات نقره و ژل پلي اكريل‌آميد با درصدهاي مختلف براي هر نشانگر استفاده گرديد. ژنوتيپ‌هاي مشاهده شده به كمك نرم افزارهاي Popgene نسخه 32/1 و Cervus نسخه 2 آناليز گرديدند. نتايج نشان دادند كه نشانگر BM6444چند شكل بوده و 4 آلل و 4 ژنوتيپ به ترتيب با فراواني‌هاي (12/0D:، 31/0C:، 38/0B:، 18/0A:) و (38/0BC: ، 12/0AB:، 18/0CD:، 32/0AD:) را در بر مي‌گيرد. شاخص چندشكلي (PIC) و تعداد آلل‌هاي موثر در اين جايگاه به ترتيب 62/0 و 42/3 بودند. براي نشانگر ريز ماهوارهاي INRA135، 6 آلل با فراواني‌هاي (19/0F:، 11/0E:، 09/0D:، 21/:0C، 25/0B:، 21/:0A) و سه ژنوتيپ با فراواني‌هاي (42/0AB:، 27/0CD:، 29/0 BD:) مشاهده گرديد. شاخص چندشكلي (PIC) و تعداد آلل‌هاي موثر در اين جايگاه به ترتيب 72/0 و 21/5 بودند. در ريزماهواره oarhh35 نتايج نشان دادند كه اين نشانگر نيز چند شكل بوده و 3 آلل با فراواني‌هاي (42/0C:، 28/0B:، 29/0A:) و دو ژنوتيپ با فراواني‌هاي (68/0BC:، 32/0AB:) را در بر مي‌گيرد. شاخص چندشكلي (PIC) و تعداد آلل‌هاي موثر براي oarhh35 نيز به ترتيب 71/0 و 48/2 بودند.

The purpose of this study was to identify the rate of polymorphism in BM6444, INRA13 and orahh35 microsatellite markers associated with Inhibin gene in Sanjabi sheep. For this purpose, blood samples were taken randomly from 100 Sanjabi sheep (78 females and 22 males) at Mehregan Breeding Station at Kermanshah. Modified salting out method was employed for extracting DNA. Subsequently, Polymerase Chain Reaction (PCR) was carried out with specific primers pairs for amplification of microsatellite marker sites. The PCR products were electrophoreses on acryl-amid gel. For detecting genotypes within the population, silver staining method was used. Genetic analyses on genotypic data were carried out using POPGEN 1.32 and Cervus 2.0 softwares. Results showed, three alleles (C: 0.42, B: 0.28, A: 0.29), and 2 genotypes respectively, (AB: 0.32, BC: 0.68) for oarhh35 marker. For this marker, PIC index was 0.71, and the effective number of allele was 2.48. INRA13 had six alleles (A: 0.21, B: 0.25, C: 0.21, D: 0.09, E: 0.11 and F: 0.12) and three genotypes (AB: 0.42, BD: 0.29 and CD: 0.27) with a PIC index of 0.72 and an effective number of allele as 5.21. For BM6444 marker, four alleles (A: 0.18, B: 0.38, C: 0.31 and D: 0.12) and four genotypes (AD: 0.32, CD: 0.18, AB: 0.12 and BC: 0.38) were identified. For this marker, the PIC index and the effective number of allele were 0.62 and 3.42, respectively