بررسي تنوع ژنتيكي ژنوتيپ هاي مختلف توتون گرمخانه اي با استفاده از نشانگرISSR و رتروترانسپوزون

Study of Genetic Diversity of Flue-Cured Tobacco )Nicotiana Tabacum L.) Genotypes using ISSR and Retrotransposon Markers

گام اول در برنامه هاي به نژادي تعيين تنوع ژنتيكي مواد اصلاحي است. استفاده از نشانگرهاي مولكولي سبب كاهش مدت زمان اصلاح و هزينه هاي پروژه هاي اصلاحي مي شود. در اين مطالعه تنوع ژنتيكي، 49 ژنوتيپ توتون با استفاده از 12 نشانگر ISSR، 3 نشانگر رتروترانسپوزون و يك نشانگر تركيبي ISSR و رتروترانسپوزون مورد ارزيابي قرار گرفتند. با استفاده از 16 آغازگر 147 نوار چندشكل به دست آمد، كه از بين آغازگرهاي مورد استفاده، آغازگر TOS-2 با 16 نوار و آغازگرهاي UBC811 و TOS-1 با 14 نوار بيشترين و آغازگرهاي UBC825 و TOS-3 با 4 نوار كمترين تعداد نوار چندشكل را ايجاد نمودند. ميزان اطلاعات چندشكلي نشانگرها بين 27/0 تا 46/0 و شاخص نشانگر از 15/1 تا 87/5 متغير بود. تجزيه به بردارهاي اصلي نشان داد كه دو مولفه اول توانستند در مجموع 75/16 درصد از واريانس كل را توجيه كند. تجزيه خوشه اي به روش UPGMA، 49 ژنوتيپ مورد مطالعه را در پنج گروه قرار داد، كه به ترتيب شامل 9، 4، 1، 13 و 22 ژنوتيپ شدند. صحت گروه بندي حاصل از تجزيه خوشه اي توسط تابع تشخيص كانوني به روش خطي فيشر با 6/79 درصد تاييد شد.

The first step in breeding programs is detecting the genetic diversity in breeding materials. Molecular markers help to reduce costs and time in breeding programs. Genetic variation in 49 genotypes of tobacco were studied using 12 ISSR markers, 3 Retrotransposon markers and the combination of ISSR and Retrotransposons. One hundred forty seven polymorphic bands were produced using 16 primers. Tos-2 primer with 16 followed by UBC811 and TOS-1 with 14 bands had the maximum and UBC825 and TOS- 3 with 4 band had the minimum polymorphic bands. PIC value varied between 0.27 to 0.46 and MI between 1.15 to 5.87. Principal Coordinates Analysis showed that the aforementioned values could explain total variation of 16.75 percent. In this study, cluster analysis using UPGMA, placed 49 genotypes in five cluster groups. Groups include 9, 4, 1, 13 and 22 genotypes, respectively. Discriminate Function via Fisherʹs linear (79.6 percent) confirmed the validity of clustering analysis result.