شناسايي و همسانه سازي آپرون كد كننده آنتي بيوتيك 4،2- دي استيل فلور گلوسينول از ژنوم Pseudomona fluorescens UTPF 68

Characterization and Cloning of Operon Enoding 2,4-Diacety Phlorouglosinol from Pseudomona Fluoresences UTP-F 68 Genome.

سويه هاي خاصي از سودوموناس هاي فلورسنت ساكن ريزوسفر، به دليل حفاظت از گياهان در برابر انواع بيمارگرها در سال‌هاي اخير توجه بسياري را به خود جلب كرده‌اند. توانايي توليد متابوليت‌هاي ضدميكروبي از جمله خصوصيات مهم اين باكتري‌ها مي‌باشد كه در حفاظت از گياهان در برابر انواع بيمارگرهاي گياهي نقش كليدي را ايفا مي‌كنند. سودوموناس‌هاي فلورسنت قادر به توليد آنتي‌بيوتيك‌هايي هستند كه در كنترل زيستي بيمارگر‌هاي گياهي نقش دارند. 2و4- دي استيل فلوروگلوسينول (DAPG)، يكي از مهمترين آنتي‌بيوتيك‌هايي است كه توسط برخي سويه هاي Pseudomonas fluorescens توليد ميشود. اين آنتي بيوتيك علاوه بر نقش بارزي كه در كنترل بيماري هاي خاكزاد گياهان دارد، داراي كاربردهايي در پزشكي نيز مي باشد؛ به طوري كه محققين آن را به عنوان تركيب موثري عليه باكتري Staphylococcus aureus (عامل ذات الريه در انسان) معرفي كردند. توليد اين آنتي بيوتيك توسط 6 ژن در سه واحد نسخه برداري كنترل مي شود. در اين مطالعه 4 ژن phlA، phlC، phlB و phlD كه به طور مستقيم در ساخت اين آنتي بيوتيك نقش دارند و به صورت يك واحد نسخه برداري و در يك اپرون سازماندهي شده اند، به كمك PCR از ژنوم Pseudomonas fluorescens UTPF 68 جداسازي گرديدند. پس از تاييد صحت جداسازي توسط تكنيك Nested PCR، اپرون جهت مطالعات بيشتر در آينده در pGEM-T easy vector كلون گرديد.

In recent years, certain strains of Florescent Pseudomonas resident in rhizosphere have considerably attracted lots of attention due to their protection role against various types of plant pathogens. The ability of antibacterial metabolites production is one of the important characteristics of these bacteria that plays a key role in plant production against pathogens. Fluorescent pseudomonades are able to produce antibiotics playing a role in the biological control of plant pathogens. 2,4 – diacetylflourogolocinol (DAPG), is one of the most significant antibiotics controlling soil borne plant diseases which is produced by strains of Pseudomonas fluorescent. The Production of the antibiotic is controlled by six genes in three transcription units. In this study, four genes : phlA, phlC, phlB, and phlD that have direct role in the synthesis of the antibiotic and have been transcribed in one unit and organized in one operon were isolated from Pseudomonas fluorescens genome using PCR. Eventually, Carrying out the validation of the isolation using the Nested PCR technique, the operon was cloned in the pGEMT-easy vector system II for the future studies.