بررسي تنوع ژنتيكي اينترون 4 ژن هورمون رشد در ماكيان بومي استان آذربايجان غربي با استفاده از روش PCR-RFLP

Genetic diversity of interon 4 of growth hormone gene in West Azerbaijan native chicken using PCR-RFLP technique

در اين تحقيق تنوع ژنتيكي ناحيه اينترون ? ژن هورمون رشد ماكيان بومي مركز پرورش و اصلاح نژاد استان آذربايجان غربي مورد بررسي قرار گرفت. از ?? قطعه ماكيان خون گيري از وريد بالي انجام شد و DNA ژنومي به روش عمومي استخراج نمكي از نمونه‌هاي خون استخراج گرديد. قطعه‌اي به اندازه ??7? جفت باز از ناحيه اينترون ? ژن هورمون رشد ماكيان مورد مطالعه با استفاده از واكنش زنجيره‌اي پلي‌مراز تكثير شد. قطعات تكثير شده بوسيله آنزيم محدود كننده MspI برش داده شدند و محصولات حاصل از برش آنزيمي بر روي ژل آگارز 2 درصد الكتروفورز گرديدند. نتايج حاكي از وجود سه نوع آلل A، B و C در اين جايگاه بود كه فراواني آنها در كل جمعيت به ترتيب 44/?4?، 22/32? و33/33? محاسبه شد. شش تركيب ژنوتيپي AA، AB، BB، AC، BC و CC شناسايي شدند كه فراواني‌هاي ژنوتيپي محاسبه شده آنها در كل جمعيت به ترتيب برابر ?1/11%، 33/23%، 22/12%، 33/23%، 66/16% و 13/13% به دست آمد. شاخص هتروزيگوتي و تعداد آلل موثر براي اين جايگاه در كل جمعيت به ترتيب 66/0 و 99/2 به دست آمد. آزمون هاي مربع كاي (?2) و جي (G2) براي توده ماكيان بومي مركز پرورش و اصلاح نژاد استان آذربايجان غربي نشان داد جامعه در حالت تعادل هاردي‌-واينبرگ قرار دارد. بر اساس اين نتايج مي توان گفت كه ژنوتيپ هاي لوكوس مورد مطالعه، تحت تاثير عوامل تغيير دهنده فراواني هاي آللي و ژنوتيپي مانند انتخاب، جهش و يا مهاجرت نبوده است. اين تحقيق يك آزمايش مقدماتي براي انجام مطالعات بعدي جهت بهبود عملكرد توليدي مرغان بومي استان آذربايجان غربي مي‌باشد.

In the present study blood samples were collected from 90 birds in order to investigate the genetic variation of interon 4 of chicken growth hormone gene (cGH) in West Azeraijan native chicken. Genomic DNA was extracted and a fragment of 1170 bp in size was amplified using polymerase chain reaction. The amplified fragments were subjected to restriction digestion with MspI endonuclease enzyme and the resultant digested products were run on 2% agarose gel. The results revealed the existence of three alleles A, B and C for the examined locus with frequencies of 34.44%, 32.22% and 33.33% respectively. A number of six different genotypic variants including AA, AB, BB, AC, BC and CC were identified with genotypic frequencies of 11.11%, 23.33%, 12.22%, 23.33%, 16.66% and 13.13% respectively. The expected hetrozygosity value and effective number of alleles were 0.66 and 2.99 respectively. G square and Chi square tests based on observed and expected frequencies of different genotypic variants of cGH gene showed that deviation from Hardy-Weinberg equilibrium was not significant for West Azerbaijan native chicken. It was concluded that the genotypes of the examined locus were not affected by genotype influencing factors such as selection, migration and mutation.