مطالعه چندشكلي در ناحيه 5 فلانكينگ ژن فاكتور رشد شبه انسولين و ارتباط آن با صفات لاشه در دو نژاد دنبه دار و بي دنبه لري بختياري و زل به روش PCR-SSCP

Study of the polymorphism at the 5’ flanking region of the ovine IGF-I Gene and its association with carcass traits in Zel (tailed) and Lori-Bakhtiari (fat-tailed) breed sheep using PCR-SSCP

فاكتور رشد شبه انسولين (IGF-I) ساختار مشابهي با هورمون انسولين دارد. اين هورمون نقش مهمي در رشد و نمو بافت هاي مختلف بدن دارد و بوسيله ژن IGF1 رونويسي مي شود. ژن فاكتور رشد شبه انسولين (IGF-I) روي كروموزوم شماره 5 گوسفند قرار دارد و داراي 6 اگزون و 5 اينترون مي باشد. پژوهش حاضر با هدف مطالعه ارتباط چندشكلي اين ژن با صفات رشد در دو نژاد دنبه دار و بي دنبه لري بختياري و زل به روش PCR-SSCP انجام شد. در اين پژوهش 4 ميكروليتر از 177 راس گوسفند نژاد زل و لري بختياري با ونوجكت هاي حاوي EDTA از سياهرگ وداجي خونگيري شد. استخراج DNA از خون با روش استخراج نمكي بهينه انجام و واكنش زنجيره اي پلي مراز (PCR) جهت تكثير قطعه 265 جفت بازي ناحيه `5 فلانكينگ ژن فاكتور رشد شبه انسولين انجام گرفت. تفاوت فرم فضايي رشته هاي منفرد PCR-SSCP براي تعيين ژنوتيپ نمونه ها استفاده شد. الكتروفورز محصولات PCR پس از تك رشته شدن قطعات بر روي ژل اكريل آميد و رنگ آميزي ژل به روش نيترات نقره انجام شد كه نتايج بيانگر چندشكلي زياد اين جايگاه بود. فراواني الگوهاي ژنوتيپي 1، 2، 3 و 4 IGF-I در گوسفندان نژاد زل به ترتيب 40/37، 98/41، 29/2 و 32/18 درصد و فراواني الگوهاي ژنوتيپي 1، 2، 3 و 4 ژن IGF-I در گوسفندان نژاد لري بختياري به ترتيب 58، 32، 4 و 6 درصد مشاهده شد.. آناليز داده ها ي صفات با نرم افزار SAS انجام گرفت. هيچ يك از ژنوتيپ هاي موجود با صفات مورد مطالعه ارتباط معني داري نشان ندادند.

The Insulin-Like Growth Factor I (IGF-I) Gene has a similar structure with Insulin hormone. That has an important functional in growth and development different tissue and transcribe. The IGF-I gene coded this hormone which located on Chromosome five which has six exons and five introns. The single nucleotide polymorphism was occurred in IGF-I gene and that associated with carcass traits in Zel (tailed) and Lori-Bakhtiari (fat-tailed) breed sheep with using PCR-SSCP marker. For this purpose, 4 mL of total blood was collected from the left jugular vein using vacuum tubes from Zel and Lori-Bakhtiari sheep breeds. Genomic DNA was purified from 1000-?l of blood samples that using the salting-out procedure and amplified region is located in the 5’ flanking region of the ovine IGF-I Gene. The IGF-I gene 5’flanking fragment was amplified which investigated with Single-Strand Conformational Polymorphism (SSCP) method for genotyping. Electrophoresis of PCR products were done on acrylamide gel that observed the polymorphic in this region. The frequency of patterns in Zel and Lori-Bakhtiari breeds were A (37.40%), B (41.98%), C (2.29%), D (18.32%) and A (58%), B (32%), C (4%), D (6%) respectively. Finally, for analysis of some traits was used SAS program. No significant associations of the SNPs in the 5’ flanking region of the ovine IGF-I Gene were observed for any trait.