بررسي چند شكلي ژنتيكي ژن هاي كانيدا(كالپاستاتين و آنتي ژن هاي لنفوسيتي گاوي) در گاوهاي نژاد سيستاني ايران با استفاده از روش PCR- RFLP

Study on the Genetic Polymorphisms of Candidate Genes(Calpastatin and BoLA) in Sistani Cattle Using PCR-RFLP

انتخاب حيوان بر اساس نشانگرهاي مولكولي يكي از جديد ترين روش هاي اصلاحي است كه مي‌تواند باعث بهبود صحت پيش بيني و پاسخ به انتخاب شود. در اين آزمايش ژن هاي كانديداي كالپاستاتين و آنتي‌ژن هاي لنفوسيتي گاوي (BoLA-DRB3) در گاوهاي نژاد سيستاني با استفاده از روش PCR-RFLP بررسي شدند. ژن كالپاستاتين در بررسي راندمان رشد و كيفيت گوشت به-عنوان يكي از ژن هاي كانديدا شناخته شده است و از ژن DRB3 به عنوان يك ژن كانديدا در ارتباط با بيماري ها و صفات ايمونولوژيكي در گاو استفاده مي شود. از 89 راس گاو نژاد سيستاني در ايستگاه تحقيقات گاو سيستاني زهك به طور تصادفي خون-گيري به عمل آمد. استخراج DNA از خون و واكنش زنجيره‌اي پلي مراز (PCR) جهت تكثير ناحيه چند شكلي ژن هاي كالپاستاتين و BoLA-DRB3 انجام گرفت. واكنش هضم آنزيمي قطعات تكثير شده ژن كالپاستاتين به وسيله آنزيم محدود الاثرMspI و ژنBoLA-DRB3 به وسيله آنزيم هاي I Rsa ، III Hae و I BstY انجام گرفت. فراواني هاي آللي M و N ژن كالپاستاتين در اين نژاد به ترتيب 764/0 و236/0 برآورد گرديد. آزمون 2? تعادل هاردي - واينبرگ را در جمعيت نشان داد. در طي اين پژوهش 19 آلل در جايگاه ژني BoLA-DRB3 مربوطه در گاو سيستاني شناسايي شد. فراواني آللي در اين نژاد بين 22/0 تا 1/0 بود و دو آلل 8* و 34* فراوان‌ترين آلل‌ها در جمعيت مورد مطالعه بودند. نتايج پژوهش حاضر نشان مي دهد كه تنوع ژنتيكي در اين نژاد مي تواند به برنامه هاي انتخابي آينده مخصوصاً انتخاب به كمك نشانگر (MAS) كمك نمايد

Selection based on molecular markers is one of the new methods that may improve progress and accuracy of selection in animal breeding programs. Candidate genes of Calpastatin and (BoLA Bovine Leucocyte Antigen DRB3) were studied. Calpastatin gene is the candidate gene investigating growth rate and meat tenderness and DRB3 is extensively evaluated as a candidate marker for associations with various bovine diseases and immunological traits. Blood samples were taken from 89 Sistani cows in Zehak Research Institute. Genomic Extraction and PCR reaction were done for detect genomic variation of Bovine Leucocyte Antigen and Calpastatin. Amplicons were digested with restriction enzymes MspI for Calpastatin and RsaI, HaeIII and BstYI for BoLA DRB3 genes, respectively. Allelic frequencies for Calpastatin were M=0.764 and N=0.236, respectively. ?2 test showed That population is in hardy-weinberg equliberium. In this studies 19 alleles were identified in the studied Sistani herd. Allelic frequencies ranged from 0.1 to 0.22 in the Sistani population. The most frequent alleles were *8 and *34. These data provide evidence that Sistani breed have a variability, which opens interesting prospects for future selection programs, especially marker-assistant selection.