بررسي روابط خويشاوندي برخي گونه هاي ماشك (Vicia spp.) بر‌اساس پروتيين هاي ذخيره اي و نشانگرهاي RAPD

Study of phylogenetic relationships of some Vicia species using storage proteins and RAPD markers

به منظور بررسي روابط فيلوژنتيكي برخي گونه‌ها، زير گونه ها و اكوتيپ هاي ماشك، 17 نمونه توسط الكتروفورز پروتيين هاي ذخيره اي دانه و 14 نمونه نيز توسط نشانگرهاي RAPD (رپيد) مورد مطالعه قرار گرفتند. پروتيين‌هاي ذخيره‌اي دانه از بذرهاي جمع آوري شده و DNA نمونه‌ها از برگ بوته‌هاي كشت شده استخراج شد. شاخص تنوع ژني ني و شانون مربوط به نشانگرهاي رپيد و پروتيين تفاوت قابل ملاحظه اي با‌هم نداشت، ولي شاخص هاي PIC و MI مربوط به نشانگرهاي پروتييني بيشتر از ميانگين اين شاخص ها در آغازگرهاي رپيد بود. در درخت فيلوژني براساس نشانگرهاي پروتييني، زيرگونه ها و اكوتيپ هاي گونه sativa در يك شاخه قرار گرفتند. در تجزيه رپيد نيز اين نمونه ها در يك شاخه بزرگ قرار گرفتند كه در زير شاخه هاي آن گونه هاي ديگر نيز قرار داشتند. دو اكوتيپ از گونه V. pannonica در يك شاخه و در رده بالاتر، گونه V. cracca قرار گرفت. ترسيم درخت فيلوژني با استفاده از تركيب داده هاي دو سري نشانگر، نتايج بهتري را ارايه كرد. گروه بندي نمونه ها با استفاده از روش تجزيه به مولفه هاي هماهنگ اصلي، با نتايج حاصل از درخت فيلوژني در هر سه حالت تاحدودي هم خواني داشت. البتّه مقايسه ماتريس فاصله مربوط به نشانگرهاي رپيد و پروتيين توسط آزمون مانتل، همبستگي كمي بين اين دو دسته داده نشان داد.

In order to evaluate phylogenetic relationships among some Vicia species, subspecies and ecotypes from Iran, 17 and 14 entries were studied using seed storage proteins electrophoresis and RAPDs markers, respectively. Total seed storage proteins were extracted from the collected seeds and DNA was extracted from leaf samples of seedlings. Nei and Shanon genetic diversity indices didnʹt show considerable difference between RAPD and storage protein data. While the PIC and MI indices for protein markers were greater than those of RAPD markers. In the phylogeny tree based on protein markers, the subspecies and ecotypes of sativa species were classified in the same group. In RAPD analysis, the subspecies and ecotypes were classified in a larger group along with other species. Ecotypes of V. panonica and V. cracca were classified in another group. Constructing the phylogenetic tree using incorporated RAPD and protein markers produced better results than separated ones. Also, classifying the entries using PCoA method was in correspondence to the classifying by phylogenetic trees. The distance matrices from RAPD and protein data were compared using Mantel test and were not observed any significant correlation between the two data sets.