شناسايي مولكولي باكتري‌هاي با پتانسيل پروبيوتيكي جداسازي شده از محصولات ‏لبني سنتي آذربايجان بر اساس ژن ‏‎16S rDNA‎

‎ Molecular Identification of Probiotic Bacteria in Traditional Dairy ‎ Products of Azerbaijan using 16S rDNA

هدف از اين تحقيق شناسايي دقيق 22 ايزوله لاكتوباسيلوس جدا شده از محصولات لبني سنتي منطقه آذربايجان است. ‏بدين منظور، ژن ‏‎16S rRNA‎‏ با جفت آغازگر‌هاي عمومي طي واكنش زنجيره پلي مراز ‏‎(PCR)‎‏ تكثير شد. قطعه‌اي به طول ‏‏1500 جفت باز مشابه با اندازه مورد انتظار تكثير شد. استفاده از 5 آنزيم برشي ‏Bsp143I‎، ‏BsuRI، ‏TaqI، ‏‎ MspIو‎ ‎HindIII‏ و مقايسه الگوي برشي حاصل از نرم افزار ‏GeneDoc، تنوع گونه‌اي در بين باكتري‌ها را نشان داد. بر اساس ‏الگوهاي برشي، ايزوله‌ها به گونه‌هاي لاكتوباسيلوس برويس، لاكتوباسيلوس پلانتاروم، لاكتوباسيلوس كازيي، لاكتوباسيلوس ‏آژيليس، لاكتوباسيلوس دلبروكي و لاكتوباسيلوس ساكي شباهت نشان دادند. از بين ايزوله‌ها، 8 ايزوله جهت همسانه‌سازي ‏انتخاب و براي توالي‌يابي ارسال شد. در مجموع، 5 ايزوله به عنوان پلانتاروم، 2 ايزوله به عنوان برويس و يك ايزوله به ‏عنوان ‏Lactobacillus sp‏. شناخته شدند. ‏

This study utilized molecular methods to identify 22 isolates from traditional dairy products of ‎Azerbaijan. PCR was carried out using the universal primers of 16S rDNA and a fragment of ~1500bp ‎was amplified. Amplified ribosomal DNA restriction analysis was performed using BsuRI, MspI, HindIII, ‎TaqI and Bsp143I. ARDRA results were compared to the restriction profile in enzymatic restriction and ‎bioinformatics analyses (GeneDoc). The isolates were identified as Lactobacillus brevis, plantarum, casei, ‎agilis and saki. To better characterize the isolates, fragments of eight isolates were amplified, cloned and ‎sequenced. The results identified five isolates as L. plantarum, two isolates as L. brevis and one isolate as ‎Lactobacillus sp. ‎