شجره شناسي ويروس آنفلوانزاي پرندگان ‌2N9H جدا شده از گله‌هاي گوشتي ايران براساس ژن پلي مراز ‌ 1PB

Phylogenetic study on Iranian Avian influenza H9N2 isolates

زمينه مطالعه :‌ ‌آنفلوانزاي پرندگان ‌2N9H براي اولين بار از بوقلمون در سال 1966 در ايالات متحده جدا و سپس در اروپا و آسيا انزيوتيك گرديد. اين ويروس براي اولين بار در ايران در سال 1377 در جوجه‌هاي گوشتي استان قزوين جدا سازي گرديد و هم اكنون در كشور اندميك است. پروتيين پلي مراز ‌1PB يكي از پروتيين‌هاي اين ويروس است كه نقش مهمي در حدت و تعيين محدوده ميزبان ايفا مي‌كند. هدف:‌ ‌هدف از اين مطالعه بررسي شجره شناسي براساس ژن پلي مراز 1 ‌)1(PB ويروس آنفلوانزاي‌ 2N9H جدا شده از گله‌هاي گوشتي در ايران طي سال‌هاي 1377 تا 1390 بود. روش‌كار: در اين مطالعه قطعه‌اي از ژن ‌1PB چهار جدايه ‌2N9H جدا شده از گله‌هاي گوشتي طي سالهاي 1377 تا 1390 تكثير و توالي يابي گرديد. سپس نتايج حاصله با ساير جدايه‌هاي اخذ شده از بانك ژن مورد تجزيه و تحليل و مطالعات شجره شناسي قرار گرفت. نتايج: بر اساس مطالعات شجره شناسي، جدايه‌هاي ‌2N9H در ايران دو گروه جداگانه تشكيل دادند و گروه ويروس‌هاي حاضر در كشور در گروه جديد خاورميانه و هند قرار گرفتند. بر اساس توالي اسيد آمينه، تغييراتي در سطح آنها مشابه جدايه‌هاي عادت يافته به موش و انسان مشاهده شد كه اين نگراني را از افزايش تمايل جدايه‌هاي كشور به ميزبان پستاندار بر مي‌انگيزد. نتيجه گيري‌نهايي: نتايج اين مطالعه نشان مي‌دهد كه ژن ‌1PB ويروسي آنفلونزاي پرندگان 2N9H در طي چرخش ويروسي در سال‌هاي متمادي در كشور ثابت باقي نمانده است.

BACKGROUND: Avian Influenza (AI) H9N2 subtype was first reported to have infected turkeys in the United States in 1966 and has been enzootic in Eurasia. In Iran, the H9N2 virus was first isolated from broiler chickens in 1998 in Ghazvin Province and it is the most prevalent subtype of influenza virus in poultry industry in Iran at the present time. The PB1 protein of influenza A viruses is an important host range and virus virulence determinant. OBJECTIVES: The purpose of this study was phylogenetic analysis of the PB1 gene of H9N2 AI virus isolated from broiler flocks in Iran during the period 1998-2011. METHODS: In this study, PB1 genes of 4 H9N2 isolates isolated from commercial chicken farms of Iran during the period 1998 to 2011 were partially amplified, sequenced and their amino acid sequences were assigned. The sequences were analyzed and phylogenetic study was done by comparing them to some deposited sequences of PB1 genes in GenBank. RESULTS: According to phylogenetic study on PB1 gene, two different groups can be distinguished among these Iranian H9N2 isolates. The current H9N2 circulating viruses in Iran are located in a new cluster of Middle East and India. The H9N2 isolates that are based on analysis of amino acid sequences of Iranian H9N2 isolates have some substitutions that are found in human and mouse adapted isolates. It seems that H9N2 isolates may show a trend to infect mammalian hosts. CONCLUSIONS: The available evidence indicates that PB1 genes of H9N2 influenza virus circulating in Iran have not been well conserved during the past years.