بررسي تنوع ژنتيكي برخي ارقام زيتون ايران با استفاده از نشانگرهاي RAPDs

Investigating the genetic diversity of some kinds of the Iranian olive using RAPD markers

ارقام زراعي زيتون ايران كه تحت يك نام معرفي مي‌گردند، داراي تنوع در درون خود هستند. در اين بررسي در مرحله اول، تنوع مولكولي 46 نمونه درخت زيتون از 10 رقم با 20 آغازگر RAPD بررسي شد. 1/53% كل نوارها چندشكل بودند. نتايج حاصل با استفاده از نرم‌افزارهاي NTSYS و SPSS آناليز گرديد. در مرحله دوم، نمونه‌هاي كاملا مشابه حذف گرديد. مجددا اين ارقام با 20 آغازگر RAPD بررسي شدند. از تعداد كل باندها، 5/79% كل باندها چندشكل بودند. از روش‌هاي مختلف براي محاسبه ماتريس تشابه و تجزيه كلاستر استفاده شد. بهترين كلاستر بر اساس ماتريس تشابه Dice و روش UPGMA به‌دست آمد. ميانگين ضرايب تشابه به روش Dice، نشان‌دهنده وجود تنوع كم در بين ارقام است. در تجزيه به مختصات اصلي، ارقام به خوبي از هم تفكيك شدند. مقايسه نتايج تجزيه خوشه‌اي، نتايج بررسي مورفولوژيك را تا حد زيادي تاييد كرد. به‌طور كلي انجام يك آزمايش مولكولي در ادامه طبقه‌بندي مورفولوژي ضروري به‌نظر مي‌رسد. در مرحله اول استفاده از نشانگرهاي RAPD براي بررسي اوليه مطالعات مورفولوژي مطلوب به‌نظر مي‌رسد. در ادامه اين مطالعه مي‌توان با استفاده از نشانگرهاي ديگر همين نتايج را تاييد نمود و چه بسا بتوان آن را دقيق‌تر ارزيابي نمود.

The agronomic types of the Iranian olives, which are distributed under a similar name, have different varieties. The molecular diversity of 46 olive tree samples of 10 cultivars (derived from two main olive cultivars, i.e. Rowghani and Gelooleh) was investigated in the initial phase of the present study using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analysis with 20 markers. The study was carried out at the National Research Center for Genetic Engineering and Biotechnology (NRCGEB). 53.1% of the marker were polymorphic. The obtained results were analyzed using NTSYS and SPSS software. During the second phase of the study, identical samples were omitted and the analysis was repeated using 20 RAPD markers. From among the 20 markers, 18 (79.5%) were polymorphic. Different techniques were applied for measuring the similarity matrix and cluster analysis. The best cluster was obtained from Dice similarity matrix and the UPGMA procedure. The average similarity coefficient obtained from Dice similarity materix indicated that the cultivars were not that much diverse. Analyzing the main characteristics of the olive cultivars differentiated them appropriately. The results of the cluster analysis confirmed the outcome of the morphologic analysis to a great extent. Generally speaking, conducting a molecular experiment along with the morpholic categorization appears essential. The RAPD markers were appropriately applied for the morphological analysis during the initial phase of the study. The obtained results can be further confirmed and analyzed using other markers.