مطالعه گونه‌هاي Cylindrocarpon همراه با پوسيدگي ريشه و طوقه ذرت و كلزا در استان خوزستان

STUDY OF THE CYLINDROCARPON SPECIES ASSOCIATED WITH CORN AND CANOLA CROWN AND ROOT ROT IN KHUZESTAN PROVINCE

به منظور شناسايي و مطالعه گونه‌هاي Cylindrocarpon همراه با ريشه و طوقه كلزا و ذرت در استان خوزستان طي سال زراعي 1386- 1385، از مزارع كلزا و ذرت در مناطق ايذه، دزفول، شوشتر، شوش، انديمشك و ملاثاني نمونه‌برداري به عمل آمد. در اين بررسي پنج گونه از جنس سيلندروكارپن شناسايي شد كه به ترتيب فراواني شامل C. destructans(96 جدايه)، C. didymium (69 جدايه)، ‌hederae C. (25 جدايه)، C. obtusisporum (14 جدايه) و C. macrodidymum (3 جدايه) بودند. جداسازي گونه‌هاي مذكور از ذرت و كلزا براي اولين بار در دنيا انجام مي‌شود. در اين تحقيق از جفت آغازگرهاي ITS4 & ITS5 براي شناسايي گونه‌هاي سيلندروكارپن استفاده شد. محصول تكثير شده از DNA جدايه‌هاي سيلندروكارپن با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي، قطعه‌اي به وزن 560-500 جفت باز تكثير نمود. مقايسه توالي‌هاي به دست آمده از گونه‌هاي فوق با توالي‌هاي موجود در بانك ژن، با استفاده از ابزار جستجويBLAST(Basic Local Alignment Search Tool)، نشان داد كه تمامي توالي‌هاي به‌دست آمده از نمونه‌هاي مورد بررسي به گونه‌هاي سيلندروكارپن تعلق دارند. گروه‌بندي گونه‌هاي سيلندروكارپن با استفاده از توالي ITS مناطق ريبوزومي مطابق با طبقه‌بندي بر اساس خصوصيات مرفولوژيكي ارايه شده است. اين مطلب نشان مي‌دهد كه تعيين توالي ITS مناطق ريبوزومي يك ابزار مفيد و كار‌آمد در ارزيابي رابطه فيلوژنتيكي گونه‌هاي جنس سيلندروكارپن است.

Root and crown rot of corn and rape seed is one of the most important disease attack to these crops at various stages of their growth and cause considerable damage to these crops. For study and identification of the Cylindrocarpon species associated with corn and rape seed plants in Khuzestan province, this study was conducted during growing season of 2006-2007. Samples were collected from different field in different region of Khuzestan In that study 207 isolates of Cylindrocarpon were recovered. isolates belonged to the 5 species which based on there frequency are as follow: C. destructans (96 ), C. didymum(69), C. hederae(25), ), C. obtusisporum(14), C. macrodidymum (3). This is the first report of the association of these species of Cylindrocarpon with corn and rape plants in the World. Cylindrocarpon isolates specific primers ITS4 & ITS5 were used. specific primers amplified a 500-560 bp band which is a confirmation of Cylindrocarpon species. Comparsion of the generated sequences from the mentioned species with the avalaible sequences in the gene Bank, using Blast Browers indicated that all of the generated sequences beloneged to the Cylindrocarpon species. Cylindrocarpon grouping using ITS sequences was corresponding to the classification of this geneus based on morfhological characteristics. This showen that sequences determination of ribosomal its rigon is a valuable tool in the assessment of the phylogenetic relation of Cylindrocarpon species.