تايپينگ مولكولي سويه‌هاي سالمونلا انتريتيديس جمع‌آوري شده از چند مركز آزمايشگاهي شهر تهران با استفاده از روش ERIC-PCR

چكيده زمينه و هدف: سالمونلا انتريكا زيرگونه انتريكا سروتايپ انتريتيديس يكي از رايج ترين سروتايپ هايي است كه باعث گاستروانتريت و باكتريمي در انسان مي شود. هدف از انجام اين مطالعه، تايپينگ مولكولي سويه هاي سالمونلا انتريتيديس جمع‌آوري شده از چند مركز آزمايشگاهي شهر تهران با استفاده از روش ERIC-PCR بود. روش بررسي: در يك مطالعه توصيفي از سال 1386 تا 1388، سويه هاي سالمونلا انتريكا سروتايپ انتريتيديس از بيماراني كه به چند بيمارستان شهر تهران مراجعه كرده بودند، جداسازي شد. شناسايي سويه‌هاي سالمونلا با استفاده از روش هاي استاندارد ميكروبيولوژي و اسلايد آگلوتيناسيون با آنتي سرم‌هاي مونو و پلي والان انجام شد و سرانجام تايپينگ مولكولي سويه‌ها و ارتباطات ژنتيكي آنها با استفاده از روش ERIC-PCR مورد بررسي قرار گرفت. يافته ها: نتايج بدست آمده حاكي از آن بود كه تمام ايزوله‌هاي مورد بررسي با روش ERIC-PCR قابل تايپ بندي بودند. تعداد باندهاي ايجاد شده در هر سروتايپ بين 6 تا 17 باند با وزن مولكولي 200 تا 3200 جفت باز متفاوت بود. بر اين اساس بطور كلي 9 الگوي مختلف (E1-E9) بدست آمد كه بيشترين تعداد (35%)، با داشتن الگوي مشابه در گروه اول (E1) قرار گرفتند. نتيجه گيري: نتايج اين مطالعه نشان داد كه شايع ترين سروتايپ سالمونلا در شهر تهران، انتريتيديس بوده و سويه‌ها به دستجات مختلف ژنوتايپي مبتني بر ERIC-PCR تعلق دارند.

ABSTRACT Background and Aim: Salmonella enterica subspecies enterica serotype enteritidis is one of the most frequent serotypes that cause gastroenteritis and bacteremia in human. The aim of the present study was to study the molecular types of Salmonella enteritidis strains isolated from different laboratory centers in Tehran by ERIC-PCR. Materials and methods: In this descriptive study from April 2008 to December 2011, Salmonella isolates were obtained from the patients admitted to several hospitals in Tehran. Salmonella isolates were identified by the standard microbiological methods and were serotyped by slide agglutination with commercial mono and polyvalent antisera. Molecular typing of the strains and their genetic relationship were investigated by using ERIC-PCR. Results: All Salmonella enteritidis strains investigated by ERIC-PCR were type able. This technique produced 6 to 17 amplified DNA bands with 200 to 3200 different bp. In general, ERIC-PCR differentiated all Salmonella enterica serotype enteritidis isolates into nine distinct clusters (E1-E9), however the majority of the strains (35%) belonged to cluster E1. Conclusion: In this study the most common serotype was Salmonella enteritidis and ERIC-PCR showed that the strains belonged to diverse genotypic clusters. Key words: Salmonella enteritidis, ERIC-PCR, Genotyping