بررسي تنوع ژنتيكي برخي از جمعيت هاي كلپوره (Teucrium polium)ايران با استفاده از نشانگرهاي مولكولي RAPD

Genetic diversity of different populations of Iranian Teucrium polium L. using RAPD markers

در اين مطالعه تنوع ژنتيكي 6 جمعيت كلپوره (Teucrium polium) جمع آوري شده از استان هاي گلستان، خراسان شمالي و سمنان با استفاده از نشانگر مولكولي RAPD مورد بررسي قرار گرفت. به اين منظور از برگ هاي جوان، DNA ژنومي استخراج شد و واكنش PCR با استفاده از 8 آغازگر RAPD بر روي DNA ژنومي جمعيت هاي مورد مطالعه انجام گرديد. براساس نتايج، در مجموع 68 نوار تشكيل شد كه 61 نوار (71/89 درصد) چندشكلي نشان دادند. پس از تهيه ماتريس صفر و يك از نوارها با استفاده از نرم‌افزار NTSYS-pc و ضريب تشابه جاكارد، ماتريس تشابه محاسبه و تجزيه خوشه اي به روش UPGMA انجام شد. محدوده تشابه ژنتيكي ژنوتيپ ها بين 33/0 تا 58/0 بدست آمد. جمعيت راميان بيشترين تفاوت را با ساير جمعيت ها نشان داد و در گروهي مجزا قرار گرفت. بيشترين شباهت نيز بين جمعيت مراوه تپه و گرماب مشاهده شد. نتايج اين مطالعه اطلاعات لازم را براي برآورد سطح تنوع ژنتيكي در مجموعه هاي ژرم‌پلاسمي جمعيت هاي كلپوره مورد بررسي براي استفاده در مطالعات ژنتيكي و اصلاح نباتات فراهم نمود. همچنين نتايج حاصل بيانگر آن است كه RAPD روش مناسبي براي ارزيابي تنوع ژنتيكي در ميان جمعيت كلپوره مي باشد.

Genetic diversity of 6 populations of Teucrium polium L., collected from different locations of Iran, was evaluated using random amplified polymorphic DNA (RAPD) data. Total genomic DNA was extracted from young leaves of plants and polymerase chain reaction (PCR) was performed using 8 RAPD primers. Sixty eight bands were obtained of which, 61 bands (89.71%) were polymorphic. All amplified fragments in each sample were scored based on presence (1) or absence (0). Matrix of genetic similarity was calculated by Jaccardʹs similarity coefficient. Cluster analysis was carried out according to UPGMA algorithm using NTSYS-pc software. The genetic similarity between genotypes ranged from 0.33 to 0.58. Results showed the population Ramian had maximum difference with other populations and classified in a separate group. Maximum similarity was observed between populations Garmab and Maraveh-Tappeh. Our results showed an appropriate level of genetic diversity among the investigated populations. Moreover, our data indicated that the RAPD method is a suitable approach for assessing genetic diversity of T. polium populations with high accuracy.