استفاده از روش رگرسيون متغير هاي ظاهري براي پيش بيني مقدار توليد شير و چربي در جمعيت گاوهاي هلشتاين ايران

Model for prediction of fat and milk production traits using of DGAT1 gene polymorphism in Iranian Holstein cattle population

چكيده ژن DGAT1 به عنوان يك ژن كانديد در كروموزوم شماره 14 براي درصد چربي و توليد شير مطرح مي باشد. اين ژن با كد كردن آنزيم دي آسيل گليسرول اسيل ترانسفراز نقش اصلي را در سنتز تري گليسيريد و در نهايت چربي شير دارد. در اين پژوهش 398 نمونه خون از گاوهاي هلشتاين استانهاي تهران و اصفهان جمع آوري گرديد، با انجام واكنش PCR يك قطعه 411 جفت بازي از اگزون شماره 8 اين ژن تكثير گرديد. تعيين ژنوتيپ افراد جمعيت با استفاده از تكنيك PCR-RFLP انجام شد. بر اساس نحوه برش آنزيم CfrI سه نوع ژنوتيپ KK ،KA ،AA شناسايي شدند، همچنين فراواني آللي K و A به ترتيب برابر با 37/0 و 63/0 تعيين شدند. سپس با استفاده از برازش GLM ، صفاتي كه اثر ژن DGAT1 برا ي آنها معني دار بود تعيين شدند و در نهايت با استفاده از كد بندي عامل هاي مدل و رگرسيون متغير هاي ظاهري، مدل هاي پيش بيني ارايه شدند. از ضريب همبستگي بين ركورد هاي واقعي و پيش بيني شده به عنوان معيار اعتبار سنجي مدل هاي ارايه شده استفاده شد. نتايج اين پژوهش نشان داد كه مدل هاي ارايه شده براي پيش بيني صفات توليد شير 305 روز، ارزش اصلاحي درصد چربي و درصد چربي بر اساس دو بار دوشش در روز، تا حدودي قادر به پيش بيني توليد مي باشند اما به دليل استفاده از حجم اطلاعات كم، مقدار عددي ضرايب همبستگي به ميزان كمي برآورد شدند. با استفاده از اطلاعات ژن ها و ركورد هاي يبشتر مي توان نتايج دقيق تري بدست آورد.

Abstract The results of multiple QTL mapping design in recent years, quantitative trait loci for milk fat percentage and milk yield was described in BTA14. With the coding of diacylglycerol-acyltransferase enzyme, DGAT1 gene has the main role in the triglyceride synthesis and finally fat milk synthesis. In this research, 398 blood samples were collected from Tehran and Esfahan province. In PCR reaction, 411 bp fragment of exon 8 DGAT1 gene was amplified. Finally, genotyping population was performed using RFLP-PCR technique. Three genotypes such as KK, AA and KA were detected. Frequencies of DGAT1 alleles (K and A) were estimated 0.37 and 0.63 respectively. Using of fitted fixed model and animals ‘records significant traits were recognized. Finally using of parameters coding and regression model prediction models were presented. Correlation coefficient was utilized for validation of prediction models. The results of this study indicated presented model can be prediction of Milk305 (milk production adjusted for milking in 305 days), EBVFP (estimated breeding value for milk fat percentage, %) and FATP2X (milk fat percentage adjusted for two milking per day, %) traits in population.