مقايسه مولكولي ناحيه ʹʹ5 ژنوم جدايه گلستان ويروس موزاييك كوتولگي ذرت (MDMV) با ديگر پوتي ويروس هاي غلات

Molecular Comparison of Genomic 5ʹʹ Region of Maize Dwarf Mosaic virus (MDMV) Golestan Isolate with other Cereal Potyviruses

ويروس موزاييك كوتولگي ذرت (Maize dwarf mosaic virus, MDMV)يكي از مهم ترين و گسترده ترين ويروس هاي ذرت در دنيا مي باشد. تحقيق حاضر به‌منظور مقايسه خصوصيات مولكولي و آناليز ترادف نوكليوتيدي نواحي كد كننده پروتيين هاي موجود در ناحيه ?5 ژنوم ويروس موزاييك كوتولگي ذرت و مقايسه آن با ساير جدايه هاي اين ويروس و نيز ساير پوتي ويروس هاي غلات انجام گرديد. بدين‌منظور گياهان ذرت با علايم موزاييك و كوتولگي از استان گلستان جمع‌آوري شد. پس از تعيين آلودگي در آزمون الايزاي غيرمستقيم با آنتي‌سرم اختصاصي MDMV يك نمونه آلوده جهت استخراج RNAي كل انتخاب شد. جهت تكثير ناحيه ي ?5 ژنوم ويروس از 5 جفت آغازگر اختصاصي استفاده شد كه 5 قطعه همپوشان شامل UTR-?5، P1، HC-Pro، P3و 6K1 به اندازه كل 3460 جفت باز به‌دست آمد. آناليز هاي مقايسه اي ترادف نوكليوتيدي اين ناحيه از ژنوم MDMV نشان داد كه جدايه ايران (گلستان) به‌ترتيب داراي شباهت 7/95 و 3/92 درصد در سطح آمينواسيدي و 5/90 و 1/85 درصد در سطح نوكليوتيدي با جدايه هاي بلغارستان و اسپانيا است و در مقايسه با ساير ويروس هاي آلوده‌كننده غلات هم گروه با MDMV بيشترين شباهت با ويروس موزاييك سورگوم از تگزاس و ويروس موزاييك نيشكر از چين به‌ترتيب با 9/72 و 3/72 درصد به‌دست آمد.

Maize dwarf mosaic virus is one of the most important and most extensive viruses of maize in the world. In this paper investigated molecular comparison and nucleotide sequence analysis of coding regions of proteins of genomic 5? region of Maize dwarf mosaic with other isolate and other cereal potyviruses. In order to this, maize plants with mosaic symptoms and dwarfing were collected from Golestan province. After verification of plants by Elisa test against MDMV antiserum, an infected sample was selected for isolation of total RNA. Amplification of genomic 5? region has been conducted using five specific primer pair that was obtained 5 overlap segments including P1, HC-Pro ، p3 و 6k1genes, as well as 5?-UTR region of the genome and was obtained 3460bp. The comparative analysis of nucleotide sequences of MDMV isolates showed that the Iranian (Golestan) isolate have 95.7 and 92.3 percent similarity at the amino acid level and 90.5 and 85.1 percent at the nucleotide level with Bulgarian and Spanish isolates respectively, and with other homogeneous viruses, MDMV had similarity maximum with sorghum mosaic virus from Texas and sugarcane mosaic virus from china 72.9 and 72.3 percent respectively