جداسازي و شناسايي Yersinia ruckeri با روش بيوشيمايي API 20E و تاييد تشخيص با روش 16SrDNA PCR- Sequencingدر ماهي‌قزل‌آلاي رنگين‌كمان در شمال ايران

Isolation and identification of Yersinia ruckeri by API 20E biochemical method and Molecular confirmation of isolation by 16Sr DNA PCR sequencing in Rainbow trout ( Oncorhynchus Mykiss ), in Northern

Yersinia ruckeri عامل بيماري (ERM) Enteric Red Mouth يا يرسينيوزيس مي‌باشد و باعث سپتي سمي در بيشتر آزادماهيان مي گردد. اين بيماري گسترش جهاني زيادي دارد و باعث ضررهاي اقتصادي در صنعت پرورش ماهي مي‌شود. بنابراين شناسايي دقيق پاتوژن براي كنترل بيماري در ماهي ضروري است. بر اساس علايم باليني اپيدمي از بيماري در ماهي‌هاي قزل‌آلاي رنگين كمان در شهر تنكابن در ايران رخ داده است. در اين تحقيق ما جهت شناسايي Yersinia ruckeri از كشت آزمايشگاهي از روش بيوشيمايي API 20E galleries و جهت تاييد اين تشخيص از روش16SrDNA PCR- Sequencing با استفاده از پرايمر universal استفاده كرده‌ايم. در مقايسه با تحقيق بيوشيميايي مشابه در روماني كه Yersinia ruckeri را با استفاده از API20E galleries شناسايي كرده و مقادير عددي مرتبط با هر گروه از 5، 104، 100 در روماني تا 5، 105، 100 در ايران متغير بود اين تفاوت به واسطه تست VP مثبت در تحقيق ما و تست VP منفي در تحقيق روماني بود.يكي از دقيق‌ترين روش هاي شناسايي PCR- Sequencing 16Sr DNA با استفاده از پرايمر universal مي‌باشد. اين تحقيق اولين شناسايي بيوشيميايي Yersinia ruckeri توسط كيت API 20Egalleries را گزارش مي‌دهد كه تاييد آن با روش 16SrDNA PCR- Sequencing امكان پذير شده است.

Yersinia ruckeri is the etiological agent of enteric red mouth disease (ERM) or yersiniosis, a general septicemia affecting mainly Salmonids. This disease is common word wide and produced considerable economic losses in the fish farming industry. Therefore current identification of pathogen from fish is essential for the effective fish disease control. An epidemic of disease in rain bow trout was occurred in Tonekabon city in Iran. In this study as well as biochemical detection we confirmed that laboratory culture based method by alignment analysis from sequences that outcome of PCR that used by universal primers. In contrast to biochemical same study in Romania that had detected Yersinia by using the API 20E gallery, numerical values corresponding to the each group have been changed from 5.104,100 at Romania to 5,105,100.in Iran. this difference due to positive VP test in our study and negative VP test was carried out in Romania The high throughput and excision detection rDNA PCR- sequencing used by universal primers rather than conventional method in this study provide a powerful addition tool to conventional methods for more accurate detection and monitoring of yersinia ruckeri. This study reports the first biochemical identification of Yersinia ruckeri by API Gallery and its confirmation by rDNA- PCR-Sequencing at the country of Iran.