آناليز فيلوژنتيكي ژن F ويروس‌هاي نيوكاسل جدا شده در ايران طي سال‌هاي 1389 و 1390

Molecular characterization of F gene and protein of Newcastle disease viruses isolated in 2008 and 2009 in Iran

بيماري ويروسي نيوكاسل يكي از بيماري‌هاي مهم طيور ميباشد كه خسارات فراواني را به دنبال دارد. باتوسعه روش‌هاي مولكولي، بيماريزايي ويروس بر اساس سكانس اسيد آمينه در ناحيه شكسته شدن ژن F ميسر شده است. در اين مطالعه سكانس 1674 اسيد نوكليوتيد ناحيه شكسته شدن ژن F ويروس نيوكاسل 10 ايزوله جدا شده از طيور مورد بررسي قرار گرفت. اين جدايه ها از همه‌گيري بيماري نيوكاسل بسيار حادي كه طي سال هاي 1389 و 1390 در ايران روي داد جدا شد. اين همه گيري منجر به تلفات بالا در طيور گوشتي، مادري و تخمگذار شد و با افت توليد در گله‌هاي تخمگذار و مادر نيز همراه بوده است. سكانس اسيدآمينه ويروس‌هاي جدا شده در اين مطالعه با روش RT-PCR با ويروس‌هاي جدا شده در مطالعات قبلي ايران و همچنين با ويروس‌هاي موجود در بانك ژن مورد مقايسه قرار گرفت تا تغيرات احتمالي مورد بررسي قرار گيرد. نتايج اين مطالعه نشان مي‌دهد كه اين جدايه ها از نظر فيلوژنتيكي با ويروس‌هاي جدا شده ايران در مطالعات قبلي متفاوت بوده و مشابه ويروس‌هاي جدا شده از طيور كشورهاي سرزمين‌هاي اشغالي فلسطين و چين بوده‌اند.

Newcastle disease is one of the most important diseases in poultry with huge economical damages. It is possible to detect virulence of virus base on molecular techniques and sequence of F gene. In this study, Sequence of 1674 nucleotide acid in cleavage site of F gene of Newcastle disease virus، was analyzed for 10 isolates in industrial poultry. These isolates were obtained from endemic of very virulent Newcastle disease in Iran during 2009 and 2010 which have caused high mortality in broiler, breeder and layers along with high egg production drop in breeders and layers. Amino acid sequences were compared phylogenetically with those of previously reported in Iran and also with the gene bank. These isolates show phylogenitically distinction from previous isolates reported in Iran. These isolates show similarity with Chinese and Israeli isolates in gene bank.