تعيين تنوع ژنتيكي جدايه هاي قارچ Fusarium oxysporum f.sp. melonis در استان خراسان رضوي با استفاده از نشانگر مولكولي AFLP

Determination of genetic variability of Fusarium oxysporum f.sp. melonis isolates in Khorassan Razavi province By AFLP molecular marker

بيماري پژمردگي فوزاريومي ناشي از قارچ Fusarium oxysporum f.sp melonis متداول ترين و گسترده ترين بيماري در خربزه است كه در چند كشور جهان و ازجمله ايران گزارش شده است. اين تحقيق به منظور تعيين تنوع ژنتيكي بيمارگر در استان خراسان رضوي انجام گرديد. براي اين تحقيق از 52 مزرعه در مناطق عمده خربزه كاري استان نمونه برداري شده، پس از خالص سازي و شناسايي قارچ، آزمون مولكولي انجام شد. از مجموعه جدايه هاي شناسايي شده، بر اساس پراكنش جغرافيايي و شدت بيماريزايي 35 جدايه براي تحقيقات مولكولي انتخاب شدند. پس از استخراج DNA بررسي تنوع ژنتيكي اين جدايه ها با استفاده از نشانگر مولكولي AFLP، روي ژل الكتروفورز پلي اكريل آميد 5/6 درصد و با كمك نرم‌افزار NTSYS صورت پذيرفت. بر اساس نتايج به دست آمده در سطح ضريب شباهت 63 درصد جدايه هاي بررسي شده در 6 گروه اصلي A، B، C، D، E و F و دوگروه تك جدايه اي جاي گرفتند. اين نتايج نشان داد كه تنوع ژنتيكي قابل ملاحظه‌اي در بين جدايه‌هاي قارچ عامل پژمردگي فوزاريومي خربزه در استان خراسان رضوي وجود دارد. از طرف ديگر با توجه به آناليز كلاستر و دندروگرام ترسيم شده چنين نتيجه گيري شد كه به جز موارد محدود بين پراكنش جغرافيايي و گروههاي ژنتيكي AFLP ارتباط مشخصي وجود نداشته و همچنين بين گروههاي بيماريزايي و منطقه جداسازي قارچ از گياه با گروههاي AFLP ارتباط معيني موجود نبود.

Fusarium wilt of melon is one of the most common and widespread disease of this crop in the world and specially Iran. This investigation was carried out to determine genetic variation of Fusarium oxysporum f.sp. melonis in Khorassan Razavi province. For this purpose 52 samples were collected from main melon cultivation region of Khorassan Razavi. After purification and identification of isolates, molecular analysis was performed. From all sampled isolates only 35 based on their geographical origin and pathogenicity for molecular analysis were selected. After DNA extraction, genetic variation based on AFLP markers, on 6.5%polyacryl amide gel electrophoresis and analysis by NTSYS software was done. Results showed at 63% similarity level, all isolates were placed in 6 AFLP groups A, B, C, D, E, F and two groups with just single member. Cluster analysis also showed there was significant genetic variation among F. oxysporum f.sp. melonis isolates in Khorassan Razavi. On the other hand according to cluster analysis it was determined that there was no specific correlation between geographical regions and AFLP genotypic groups. Also, no identified specific correlation was found between pathogenicity groups and isolated point of plant with AFLP groups.