تعيين توالي در چند ناحيه ژني(MLST):يك روش تايپينگ مولكولي باقدرت تمايز بسيار بالا جهت شناسايي گونه هاي كانديدا آلبيكنس در مطالعات اپيدميولوژيكي

Multilocus Sequence Typing: a Molecular Typing Method with High Discriminatory Power for Identification of Candida Albicans Strains in Epidemiological Studies

گونه هاي كانديدا مخمرهايي هستند كه در همه جا يافت مي شوند و به راحتي از محيط جدا مي شوند. آن ها جز پاتوژن هاي فرصت طلب انسان ها هستند. كانديديازي سدر بيماران با ضعف سيستم ايمني، نيازمند تشخيص و اقدام درماني سريع م يباشد. كانديدا آلبيكن س بيشترين گونه جدا شده از اين بيماران است. جهت پيشگيري از عفونت هاي بيمارستاني ناشي از كانديدا آلبيكن س، تشخيص مولكولي آن ها براي درك بهتر اپيدميولوژي اين عفونت ها و اتخاذ استراتژي هاي پيشگيري مناسب ، ضروري است . در يكي دو دهه اخير ، روش هاي تايپينگ مولكولي مختلفي براي كانديدا آلبيكنس شرح داده شده است. يكي از اين روش ها، تعيين توالي در چند ناحيه ژني روشي MLST . است كه براي مطالعات اپيدميولوژيكي و جمعيتي، بسيار كاربرد دارد (Multilocus sequence typing يا MLST) با قدرت تمايز بسيار بالا متكي بر آناليز پلي مورفيسم هاي نوكليوتيدي در توالي هاي 7 ناحيه ژني براي كانديدا آلبيكنس است. توالي هاي يا ST) به دست آمده از هر ناحيه ژني به عنوان يك آلل و آلل هاي به د ست آمده در هر ناحيه ، در مجموع ، يك سكانس تيپ قابل دسترس مي باشد كه با استفاده از نتايج www.mlst.net ناميده مي شود. در اين زمينه، پايگاه داده ها در سايت (Sequence type تايپينگ گونه ها در اين پايگاه، آناليز داده ها انجام مي گيرد. آناليز تعداد زيادي كانديدا آلبيكن ساز ميزبان هاي مختلف و مواضع باليني باعث افزايش بينش محققان در اپيدميولوژي عفونت هاي كانديدايي كسب شده از بيمارستان به علاوه ساختار ،MLST متفاوت با روش جمعيتي كانديدا آلبيكن سمي شود و الگوهاي انتقال و تكامل كانديدا آلبيكن سآشكار مي گردد و به ارزيابي تنوع ژنتيكي و پويا شناسي جمعيت كانديدا آلبيكنس، كمك مي كند.

Candida spp. are ubiquitous yeasts commonly. Those are commensally and opportunist pathogens in humans. Candidiasis in immunocompromised patients and patients with severe underlying diseases or critical illnesses need aggressive diagnosis or treatment procedures. Candida albicans (C. albicans) is the most frequently isolated species. For prevention of nosocomial infections caused by C. albicans, molecular characterization of the isolates is essential to understand the epidemiology of the infections and for tailoring prevention strategies. During the past two decades, different typing methods described for molecular characterization of C. albicans. Multilocus sequence typing (MLST), as one of these methods, is available for the development of global epidemiological studies. MLST relies on DNA sequence analysis of nucleotide polymorphisms within 7 housekeeping genes with highly discriminating power. For each locus, the different sequences are assigned as distinct alleles, and for each isolate, the alleles at each of the sequenced loci define a sequence type (ST). In this context, global internet-linked databases are now available at www.mlst.net and allow results from strains typed anywhere in the world to be integrated and managed. Analysis of a large number of C. albicans isolates from various hosts and clinical situations carried out with MLST method can provide important insights into the epidemiology of hospital-acquired Candida infections as well as the C. albicans population. With an increased use of this technique, worldwide epidemiological studies will be facilitated and should reveal the patterns of transmission and evolution of C. albicans and help to evaluate the genetic diversity and dynamics of C. albicans population.